Master Degree / Yüksek Lisans Tezleri
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/3008
Browse
2 results
Search Results
Master Thesis Development and Characterization of Solanum Linnaeanum Hairy Root Lines(01. Izmir Institute of Technology, 2024) Doğanlar, Sami; Doğanlar, Sami; 04.03. Department of Molecular Biology and Genetics; 04. Faculty of Science; 01. Izmir Institute of TechnologySolanum lınnaeanum, birçok Afrika ülkesinde geleneksel olarak tedavi edici özellikleri nedeniyle sıkça kullanılır ve Solanum melongena'nın yabani bir akrabasıdır. Fenolik bileşikler ve glikoalkaloitler de dahil olmak üzere bu bitkinin ürettiği birçok ikincil metabolit, antibakteriyel, antifungal ve antiviral özellikler gösterir. Tüylü kök kültürleri ikincil metabolitlerin üretimi ve bitkinin metabolik yolaklarının çalışılması için sıkça kullanılan bir bitki doku kültürü yöntemidir. Bu çalışmada, S. l?nnaeanum ve S. melongena eksplantlarından tüylü kök hatları oluşturmak için Agrobacter?um rh?zogenes'in agropin suşlarından biri olan ATCC 43057 kullanıldı. İstatistiksel olarak anlamlı olmamasına rağmen, transformasyon verimliliği iki tür için de hipokotil eksplantlarında kotiledon eksplantlarına göre daha yüksek olarak bulundu. T-DNA bölgesinin bitki genomuna entegrasyonu PCR ile doğrulandıktan sonra, transforme edilen tüylü kökler sıvı MS besi yerinde büyütüldü ve biyokimyasal analizler yapıldı. Analizler sonucunda, S. melongena tüylü kök hatlarıyla karşılaştırıldığında, S. l?nnaeanum tüylü kök hatlarında total fenolik (5,75 mg/g kuru ağırlık) ve total flavonoid (14,85 mg/g kuru ağırlık) içeriğinin ve total antioksidan kapasitesinin (11,45 mg/g kuru ağırlık) daha yüksek olduğu gözlemlendi. Ayrıca, myb1, HQT ve Game9 genlerinin ekspresyon analizi S. l?nnaeanum tüylü kök kültürlerinde daha fazla mRNA seviyeleri gösterdi. Bu sonuçlar, ikincil metabolit üretimi için S. l?nnaeanum tüylü kök kültürlerinin, elisitörler veya biyoreaktörler kullanılarak daha da geliştirilebilecek potansiyel bir kaynak olabileceğini göstermektedir.Master Thesis Characterization of Peppers for Antioxidant Content and Virus Resistance(Izmir Institute of Technology, 2008) Keçeli, Mehmet Ali; Doğanlar, Sami; Doğanlar, Sami; 04.03. Department of Molecular Biology and Genetics; 04. Faculty of Science; 01. Izmir Institute of TechnologyIn the first part of this study, total water soluble antioxidant activity, phenolic compounds and vitamin C content of 29 Turkish and 14 non-Turkish pepper cultivars were determined. Significant trait diversity was found in the cultivars with the most variation (7.4-fold) seen for total antioxidant capacity which ranged from 2565 to 18957 .mol Trolox/kg. Vitamin C content for the peppers ranged from 522 to 1631 mg/kg, a 3.1-fold difference, while total phenolic content for the pepper cultivars ranged from 607 to 2724 mg/kg, a 4.5-fold difference. A strong correlation between total antioxidant capacity and phenolic content (r . 0.71) was also seen. Significant variation for antioxidant content in Turkish germplasm indicates that this material can be used for improvement and genetic mapping of nutritional content in pepper. In the second part of this study, amplified fragment length polymorphism (AFLP), cleaved amplified polymorphism (CAPs) and simple sequence repeat (SSR) markers were used to map gene(s) for cucumber mosaic virus resistance. The mapping was conducted using a F2 population derived from a cross between Capsicum annuum cv. Jupiter (susceptible) X C. frutescens (resistant). The F2 population, consisting of 76 individuals, was screened with 13 AFLP primer pairs, 60 CAPs markers and 30 SSR markers to detect markers possibly linked to CMV resistance gene(s). As a result, 7 QTL were found which are related with resistance to CMV in pepper. This will provide pepper breeders an opportunity to use these markers for marker-assisted selection for CMV resistance in pepper.