Master Degree / Yüksek Lisans Tezleri

Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/3008

Browse

Filters

2010 - 201912020 - 20251

Settings

Author: search.filters.author.Kılıç, Emre

Search Results

Now showing 1 - 2 of 2
  • Master Thesis
    NRAV Uzun Kodlamayan RNA'sının NRAs Mutant Melanomunda Tip-1 İnterferon Yanıtındaki Rollerinin İncelenmesi ve Uzun Kodlamayan RNA İfade Örüntülerinin Kanserde Hayatta Kalımla İlgisinin Araştırılması
    (2025) Ekiz, Hüseyin Atakan; Ekiz, Hüseyin Atakan; 01. Izmir Institute of Technology; 04. Faculty of Science; 04.03. Department of Molecular Biology and Genetics
    Deri kanseri (melanom), bağışıklık tepkilerinden kaçma yeteneğiyle bilinen agresif bir cilt kanseridir. Tip I interferonlar (IFN'ler) (IFN-A/B), antitümör bağışıklığını artırmada önemli bir rol oynar, ancak bu yolağın melanomdaki uzun kodlamayan RNA'lar (lncRNA'lar) tarafından düzenlenmesi yeterince anlaşılmamıştır. NRAV (Antiviral Yanıtın Negatif Düzenleyicisi, Negative Regulator of Antiviral Response), daha önce viral enfeksiyon sırasında IFN ile uyarılan genleri (IFN stimulated genes, ISG'ler) baskıladığı gösterilen, ancak melanom gibi kanser bağlamlarında karakterize edilmeyen bir lncRNA'dır. Mevcut tez çalışmasında, NRAS mutasyona uğramış SKMEL147 hücreleri kullanılarak NRAV'ın melanomdaki tip I IFN sinyallemesi üzerindeki etkisini araştırmak amaçlanmıştır. Bulgular, NRAV aşırı ifadesinin erken zaman noktalarında IFN-A uyarımını takiben baskılanmış ISG (IFIT2, IFIT3, MX1), HLA-A ve PD-L1 ifadesine yol açtığını göstermektedir. NRAV aşırı ifade edilen hücreler ayrıca azalmış çoğalma ve artmış hücre ölümü sergilediler. Proteomik analizin ardından RNA çöktürme (RNA pulldown), mitofaji ve translasyonda yer alan belirgin bir NRAV'le ilişkili protein seti ortaya çıkardı ve NRAV'nin potansiyel tepkime hedeflerini vurguladı. Ek olarak, makine öğrenme algoritmaları tarafından yapılan biyoenformatik analiz, özellikle tip I IFN yanıtında bir oyuncu olan IRF9 ile birleştirildiğinde, ifadesi melanom hastalarında iyileştirilmiş veya kötüleştirilmiş sağkalımla ilişkili olan birkaç IFNA ile ilişkili lncRNA'yı tanımladı. Bu bulgular birlikte, NRAV'nin melanom ve tip I IFN yanıtındaki düzenleyici rolünü ve IFN ile ilişkili lncRNA'ların daha geniş prognostik önemini vurgulamaktadır.
  • Master Thesis
    An Investigation of Activities and Selectivities of Hzsm-5 and H-Ferrierite Zeolites Modified by Different Methods in N-Butene Isomerization
    (Izmir Institute of Technology, 2010) Kılıç, Emre; Yılmaz, Selahattin; Yilmaz, Selahattin; 03.02. Department of Chemical Engineering; 03. Faculty of Engineering; 01. Izmir Institute of Technology
    In this study the synthesis and preparation of active and selective zeolite catalysts for the skeletal isomerization of 1-butene to iso-butene reaction were investigated. Since this reaction occurs on the acid sites, acidity of the catalyst plays important role on catalyst activity and isobutene selectivity. The acidity of synthesized HZSM-5, commercial Ferrierite (H-FER) and HZSM-5-C zeolite catalysts were modified by chemical liquid deposition (CLD) using tetraetyhyl orthosilicate (TEOS), SiCl4 and triaminopropyltriethoxysilane (3-amino), alkali, acid and ammoniumhexafluorosilicate treatment methods. Reaction tests were performed in a fixed bed reactor at 375 0C at weight hour space velocities of 22 h-1. SiCl4 deposition dramatically decreased the total acidity and surface area, both conversion and selectivity of the catalysts whereas TEOS increased selectivity. The highest selectivity (81.2 %) among CLD agents, were obtained by H-FER modified by TEOS 1 hour 1 cycle. Mild alkali treatment slightly decreased the acidity, which increased selectivity for H-ZSM5 from 57 to 60. However severe alkali treatment decreased the selectivity of the catalysts since some acid sites increased after this treatment. Acid treatment significantly decreased the surface area, acidity and caused dealumination. As a result catalyt activity decreased by 10 %. However, selectivity to isobutene changed slightly. Pre-alkali treatment before acid treatment decreased the dealumination effect, so this increased the selectivity; for H-ZSM5 from 57 to 66. AHFS treatment decreased the acidity slightly without affecting other properties. This increased the selectivity of H-ZSM5 from 58 to 87. The highest selectivity values were obtained for AHFS treatment among all modifications.