Master Degree / Yüksek Lisans Tezleri

Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/3008

Browse

Search Results

Now showing 1 - 2 of 2
  • Master Thesis
    Comparison Of Interaction Of Poly(Ethylene Glycol) And Poly(Oligo (Ethylene Glycol) Methyl Ether Methacrylate) With Water Using Molecular Dynamics Simulation
    (01. Izmir Institute of Technology, 2025) Abbas, Yawer; Zareıe, Esma Volga Bulmuş; 03. Faculty of Engineering; 03.09. Department of Materials Science and Engineering
    Bu tez, MD simülasyonları kullanarak konformasyonel, hidrasyon ve H-bağlanma özelliklerini inceleyerek polietilen glikol (PEG) ve poli(oligo(etilen glikol) metakrilat) (POEGMA)'ın su ile etkileşimini karşılaştırmaktadır. 4, 8, 12, 16 ve 20 tekrarlayan birim içeren POEGMA ile 20 ve 40 birim içeren PEG'in moleküler modelleri Avogadro ve CHARMM GUI yazılımları kullanılarak hazırlanmıştır. Tüm polimerler TIP3 su kutularında çözündürülmüştür. Bağlanmış ve bağlanmamış etkileşimler için Charmmff parametreleri kullanıldı. MD simülasyonları TRUBA yüksek performanslı hesaplama platformunda LAMMPS yazılımı kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Kısa minimizasyon ve 1 ns'lik dengeleme çalışmalarının ardından 15 s'lik üretim çalışması gerçekleştirilmiştir. Elde edilen yörüngeler VMD yazılımı ve MD analizi kullanılarak düzenlenmiş ve analiz edilmiştir. İki polimerin sulu ortamdaki davranışlarını karşılaştırmak için dönme yarıçapı (Rg), su kabuğu ve hidrojen bağı gibi temel özellikler araştırılmıştır. Sonuçlar her iki polimerde de belirgin farklılıklar ortaya koymuştur. PEG, aynı sayıda tekrar eden etilen glikol birimine sahip POEGMA ile karşılaştırıldığında, kompakt rastgele sarmal yapı oluşturan biraz daha düşük ve daha az kararlı (her bir PEG zinciri için ortalama 9,73 ve 13,41 Å) Rg değerleri sergilemiştir. Su kabuğu analizi, PEG etrafındaki su kabuğundaki su molekülü sayısının (N(H2O)) (PEG20 ve 40 için sırasıyla ortalama N(H2O) 244.9 ve 418.6) esas olarak kararlı olmadığını göstermiştir. Su molekülü sayısındaki kararsızlık, konformasyonun kararsız olmasına atfedilmiştir. Son olarak, POEGMA ile karşılaştırıldığında, PEG ile daha yüksek bir ortalama H-bağı sayısı gözlemlenmiştir. Öte yandan, POEGMA biraz daha yüksek Rg değerleri ve kısa zincirler için kararlı bir yapı sergilemiştir (4 ve 8-mers POEGMA için sırasıyla 13,46 ve 15,78 Å). Zincir boyutu ile Rg değerlerindeki artış PEG'e kıyasla daha küçük çıkmıştır. Ayrıca, POEGMA zincirlerinin çok daha kararlı ve daha fazla N(H2O) değerlerine sahip olduğu bulunmuştur. Bununla birlikte, eşdeğer POEGMA için H-bağı sayılarının daha düşük olduğu bulunmuştur. Zincir boyunca H-bağı dağılımı da PEG ve POEGMA zincirleri için farklıdır. Anahtar Kelimeler: PEG, POEGMA, MD simulasyonu, dönme yarıçapı, su kabuğu analizi, H bağı analizi
  • Master Thesis
    Effects of Dimethyl Ether on N-Butane Oxidation
    (Izmir Institute of Technology, 2011) Bekat, Tuğçe; İnal, Fikret
    Effects of dimethyl ether on the oxidation of n-butane were investigated using Detailed Chemical Kinetic Modeling approach. Oxidation process was carried out in a tubular reactor under laminar flow conditions. The formations of various oxidation products, especially toxic species were investigated for the addition of dimethyl ether in different mole fractions to n-butane. Pure dimethyl ether oxidation was also investigated for comparison. Pure dimethyl ether oxidation resulted in lower mole fractions of carbon monoxide, methane, acetaldehyde and aromatic species, but higher mole fractions of formaldehyde when compared to pure n-butane oxidation. The addition of dimethyl ether to n-butane in different mole fractions was observed to decrease mole fractions of acetaldehyde and aromatic species and increase the mole fraction of formaldehyde, while other toxic species investigated were not affected significantly. The effects of three important process parameters on the formations of oxidation products were also investigated. Inlet temperatures between 500 and 1700 K, pressures of 1 and 5 atm, and equivalence ratios of 2.6 and 3.0 were studied. Increasing pressure and equivalence ratio were observed to increase the mole fractions of toxic species in general. The effect of temperature was more complicated depending on the species and the temperature interval. Reaction path analysis indicated that the most important precursors playing role in the formation of the first ring benzene were acetylene, ethylene, propargyl, allene, allyl, propene and fulvene during n-butane/dimethyl ether oxidation. Finally, a skeletal chemical kinetic mechanism was developed and validated for the oxidation of n-butane/dimethyl ether mixture.