Master Degree / Yüksek Lisans Tezleri

Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/3008

Browse

Filters

2015 - 201912020 - 20241

Settings

Language: search.filters.language.enSubject: search.filters.subject.Stem cells

Search Results

Now showing 1 - 2 of 2
  • Master Thesis
    Investigation of Malignant Melanoma Cancer and Cancer Stem Cells Using Optical Spectroscopy Techniques
    (01. Izmir Institute of Technology, 2024) Uslu, Bensu Rüya; Güler, Günnur; Güler, Günnur; 04.05. Department of Pyhsics; 04. Faculty of Science; 01. Izmir Institute of Technology
    Kanser kök hücreleri, kök hücre ve progenitör hücrelerdeki akümüle mutasyonlardan kaynaklanan kanser hücrelerinin düşük bir yüzdesini oluşturmalarına rağmen kanserin tekrarından, tedaviye direnç göstermesinden ve metastazından büyük ölçüde sorumludurlar. Malign melanom yaygın bir kanserdir, ve insidansı, mortatalitesi ve morbitesi alarm verici seviyede artmaktadır. Bu çalışmanın amacı kanser kök hücrelerinin malign melanom modeli üzerinde titreşimsel spektroskopi ile incelenmesidir. Titreşimsel spektroskopi moleküllere dair hem nitel hem nicel bilgi verir. Yani hücrelerin biyokimyasal içeriği ve moleküllerin miktarı titreşimsel spektroskopi ile belirlenebilir. Dahası, deney grupları arasındaki ilişkiler ve spektral verinin istatistiksel önemi kaydedilen spektrumlara çok-değişkenli Analiz yöntemleri uygulanarak değerlendirilebilir. Titreşimsel spektroskopi, infrared ve Raman spektroskopileri, hücresel ve diğer biyolojik çalışmalarda yaygın olarak kullanılmaktadır ve başarılı sonuçlar elde edilmektedir. Bu çalışmada, kanser kök hücreleri, kök hücre olmayan kanser hücreleri ve bulk hücre popülasyonu hücreleri infrared ve Raman spektroskopileri ile incelenmiştir ve elde edilen veriler hücre döngüsünün 11, 24, 48 ve 72. saatlerinde çok-değişkenli yöntemlerle analiz edilmiştir. Sonuç olarak, üç grup arasındaki biyokimyasal ve biyofiziksel farklar farklı saatler için belirlenmiş ve hücrelerin hüçre döngüsüne ilişkin bilgiler elde edilmiştir. Bu çalışma titreşimsel spektroskopinin hücre karakterizasyonunda kullanılabileceğini ve çok-değişkenli analizlerle birleştirildiğinde spektrumlardan elde edilen bilginin ciddi ölçüde geliştirilebileceğini desteklemektedir.
  • Master Thesis
    Molecular Characterization of Adult Stem Cells' Adaptations To Mechanical Signals During Adipogenic Commitment
    (Izmir Institute of Technology, 2015) Özçivici, Engin; Baskan, Öznur; Baskan, Öznur; Yalçın Özuysal, Özden; Özçivici, Engin; Yalçın, Özden; 03.01. Department of Bioengineering; 01. Izmir Institute of Technology; 04.03. Department of Molecular Biology and Genetics; 03. Faculty of Engineering; 04. Faculty of Science
    Prevalence of obesity have increased across the years based on technological developments that supported nutritional availability and sedentary lifestyles. Restoring mechanical activity with physical exercise suppresses obesity, and mechanical loading can also be delivered passively with whole body vibrations with high frequency and low magnitude. Anabolic effects of high frequency low magnitude mechanical vibrations on adult stem cells are well identified whereas sensing mechanism of cells and their response to mechanical stimuli is largely unknown. Here, we hypothesed that daily bouts of low intensity vibrations will affect molecular, physical and ultrastructural profile of the cells and the effect will interact with the adipogenic induction. To test this hypothesis mouse bone marrow stem cell line D1 ORL UVA were subjected to mechanical vibrations (0.15g, 90 Hz, 15min/d) for 7 days to both during quiescence and adipogenic commitment. Ultrastructural changes were identified on cellular and molecular levels. Atomic force microscopy was used to characterize the changes on cell surface and significant increase was observed in cell surface height. Moreover, in order to identify the changes in cytoskeleton structure and physical properties, actin were stained with phalloidin and imaged with inverted microscope. To quantify phalloidin amount, signal intensities and physical features of the cells were measured. It was observed that mechanical stimulation and adipogenic induction affect actin content and the physical structure of the cells significantly. Molecular level analysis of cytoskeleton elements and adipogenic markers were performed with Real time PCR. Dramatic increases in adipogenic markers were detected with adipogenic induction. These results indicate that mesenchymal stem cells responds to mechanical vibrations by altering their molecular and ultrastructure during both quiescence and adipogenesis.