Master Degree / Yüksek Lisans Tezleri

Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/3008

Browse

Filters

20172

Settings

Author: search.filters.author.Arslanoğlu, AlperSubject: search.filters.subject.HIV-1

Search Results

Now showing 1 - 2 of 2
  • Master Thesis
    Investigation of the Effects of Hiv-1 and Siv Agm Tat Proteins on Slpi Gene Expression in Chlorocebus Sabaeus Kidney (vero) Cell Line
    (Izmir Institute of Technology, 2017) Özkan, Aysu; Arslanoğlu, Alper
    Even though Human Immunodeficiency Virus (HIV) can infect Old World Monkey (i.e African Green Monkey) cells, replication of the virus is hampered with different kinds of restriction mechanisms before the integration of viral genome to host genome. After viral integration to host genome, HIV-1 TAT protein is expressed, which plays an important role for the generation of other proteins for viral production. Previous studies which were performed in our laboratory indicate that Secretory Leukocytes Protease Inhibitor (SLPI) overexpressed in existence of HIV-1 TAT protein. This result was confirmed with 2D-PAGE, qRT-PCR and Western Blot Analysis. The aim of this study is to understand how Vero Stable Cell Lines which produces HIV-1 TAT protein can affect expression levels of SLPI. At mRNA level of SLPI expression was confirmed with qRTPCR. In order to measure SLPI expression at the protein level in the presence of HIV-1 TAT,Western Blot and Sandwich Elisa methods were used. Luciferase Assay process was performed in order to measure the effects of SLPI on HIV-LTR. Consequently, expression of SLPI in Vero Stable Cell Line increased in the existence of HIV-1 TAT protein. Additionally, SLPI inhibits HIV-LTR function through suppressing NF- κB promoter which exists in HIV-LTR.
  • Master Thesis
    Investigation of the Effects of Siv Agm Tat Protein on Slpi Gene Expression in Primate Cells
    (Izmir Institute of Technology, 2017) Demirci, Dilara; Arslanoğlu, Alper
    Afrika Yeşil maymunu (AYM) gibi Eski Dünya maymunları HIV-1’e karşı dirençlidirler. Türlerine spesifik simian bağışıklık yetmezlik virüsü (SIV) ile enfekte olabilmelerine rağmen AIDS benzeri bir sendrom geliştirmezler. Bazı restriksiyon faktörlerinin, HIV-1 replikasyonunu engelleyerek bu organizmaları enfeksiyona karşı koruduğu bilinmektedir. Eski Dünya maymunları hücreleri çok yüksek viral yük kullanıldığında, başarılı bir şekilde enfekte edilebilmelerine rağmen, bu hücrelerde virüs sayısının zamanla saptanamayacak seviyelere düşmesi, bu hücrelere dirençlilik sağlayan henüz tanımlanmamış restriksiyon faktörlerinin varlığını göstermektedir. Eski Dünya maymunları viral proteinlerin üretimine karşılık olarak bazı genlerinin ekspresyonlarını değiştirerek bir direnç mekanizması oluşturmuş olabilirler. HIV-1 Tat, virüsün hücre içine girişinden sonra üretilen ilk viral protein olduğundan ve diğer HIV-1 proteinlerinin sentezlenmesi için varlığı gerekli olduğundan, bu maymunların geliştirdiği direnç mekanizmasında önemli bir rol oynaması mümkündür. Laboratuarımızda yapılan ön çalışmalarda, antiproteaz, antimikrobiyel ve antiviral aktivitesi olan Salgısal Lökosit Proteaz İnhibitor (SLPI) proteini olası bir restriksiyon faktörü olarak belirlenmiştir ve AYM hücrelerinde HIV tat varlığında bu proteinin aşırı ifadelendiği gözlemlenmiştir HIV ve SIV tat genlerinin işlevleri benzer olduğu halde, aminoasit dizilimleri çok farklıdır (≈%40 benzerlik). Bu nedenle HIV-1 Tat ve SIV-Tat proteinlerinin SLPI geni ifadelenmesine etkileri farklı olabilir. Bu çalışma AYM hücrelerinde SIV AYM Tat proteininin SLPI üretimine etkisini incelemeyi amaçlamaktadır. Bu amaçla, SIV tat genini kalıcı olarak ifadeleyen AYM hücrelerinde SLPI ifadelenmesi Q-PCR ve Western blotlama yöntemleriyle incelenmiştir. SIV Tat varlığında SLPI ifadelenmesi belirgin olmayan bir şekilde azalırken, HIV Tat varlığında anlamlı bir artış gözlemlenmistir.