Master Degree / Yüksek Lisans Tezleri

Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/3008

Browse

Filters

2003 - 200912020 - 20241

Settings

Subject: search.filters.subject.Biosynthesis

Search Results

Now showing 1 - 2 of 2
  • Master Thesis
    Proteomic analysis of benzylisoquninoline alkaloid (BIA) biosynthesis in different opium poppy cultivars and examination of differentially expressed proteins in relation to bia content
    (01. Izmir Institute of Technology, 2024) Taşdemir, İrem; Frary, Anne
    Haşhaş (Papaver somniferum), eczacılıkta kullanılan benzilizokinolin alkaloidleri (BIA) üretmesi nedeniyle Türkiye için stratejik öneme sahip bir bitkidir. Yalnızca haşhaş bitkisinden elde edilebilen bu alkaloidler, ağrı kesici, öksürük kesici ve narkotik amaçlı ilaç olarak yaygın şekilde kullanılmaktadır. Türkiye'nin haşhaş çeşitleri, yüksek BIA içeriği hedeflenerek geliştirilmiş olup küresel rekabet için verimlerinin artırılması gerekmektedir. Bu çalışmada, farklı haşhaş çeşitlerinin belirli organlarındaki protein seviyelerinin değişen BIA içeriği ile ilişkili olarak karşılaştırılmasını içeren proteomik bir yaklaşım kullanılmıştır. Çalışmada, belirli alkaloidler açısından öne çıkan üç Türk haşhaş çeşidi kullanılmıştır: tebain (TMO T), morfin (Ofis 2) ve noskapin (Ofis NM). Haşhaş bitkisinin belirli dokularından alınan protein ekstraktları, LC-MS/MS kullanılarak incelenmiş ve ardından kuru kapsüllerdeki BIA miktarı TLC/HPLC analizleriyle ölçülmüştür. Bu şekilde, farklı haşhaş çeşitlerinin ve organlarının protein ekspresyon modelleri ile kapsüllerdeki alkaloid birikimi arasındaki bağlantılar araştırılmış ve BIA metabolizmasının biyosentetik ve düzenleyici yollarına dair bilgi edinilmiştir. İncelenen beş doku arasında, olgun kapsüller en yüksek sayıda anlamlı farklı şekilde ifade edilen proteini gösterirken, Ofis 2 protein ifade profilleri açısından tüm dokularda TMO T ve Ofis NM'den belirgin şekilde ayrışmıştır. BIA yolağındaki kilit enzimler, üç haşhaş çeşidinin kapsülleri ve lateks içeren gövdeleri arasında anlamlı yukarı ve aşağı regülasyon göstermiştir. Gelecekteki araştırmalar, BIA biyosentezini aydınlatmak ve manipüle etmek için karakterize edilmemiş proteinlerin işlevlerini, çoklu omik entegrasyonunu, dokuya özgü enzim lokalizasyonunu ve işlevsel gen çalışmalarını araştırabilir. Bu sayede farmasötik amaçlar için yüksek verimli haşhaş çeşitlerinin geliştirilmesine olanak sağlanabilir.
  • Master Thesis
    Production and Isolation of Fungal Chitosan by Submerged Fermentation
    (Izmir Institute of Technology, 2003) Alper, Seda; Harsa, Hayriye Şebnem
    Chitosan is the N-deacetylated derivative of chitin which is the supporting material of crustaceans and insects. Chitosan together with chitin are recommended as suitable functional materials because of their excellent biocompatibility, biodegradability, non-toxicity and adsorption properties and can be used in agriculture, biotechnology and food industry. Although chitosan is produced by chemical deacetylation of chitin molecule, it is also a natural component of cell walls of fungi belonging to Zygomycetes and can be produced by extraction from fungus cell walls. Fungi are thus the promising alternative sources of chitosan. Fungi can be manipulated to give chitosan of more consistent and desired physico-chemical properties compared to chitosan obtained from crustacean sources. In this study, Absidia spp, Aspergillus niger, Rhizopus arrhizus, Cunnighamella elegans, and Mucor rouxii were examined for biomass growth. At first, all five species were grown on synthetic medium at 28 C, 180 rpm in shake-flask incubator. Mucorrouxii which gave the maximum biomass concentration was also grown on molasses. The maximum biomass concentration of Mucor rouxii was found to be higher than that of synthetic medium. The best growth conditions obtained were 4% sucrose, 0.2% yeast extract, 1% peptone and 106 spores in 40 ml. The mycelia harvested at late exponential phase was treated with alkali to remove proteins and chitosan was extracted from cell wall by using acetic acid. The yield of extractable chitosan obtained from cell wall of Mucor rouxii was 2500 mg / l and it is almost 20 % of biomass and approximately 35 % of alkali insoluble fraction.