TR Dizin İndeksli Yayınlar / TR Dizin Indexed Publications Collection
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/7149
Browse
2 results
Search Results
Research Project (R)-klavuzon Z'nin karaciğer kanser hücreleri ve karaciğer kanser kök hücreleri üzerindeki antikanser özelliklerinin incelenmesi(2015) Erdal, Esra; Delman, Murat; Çağır, Ali; 04.01. Department of Chemistry; 04. Faculty of Science; 01. Izmir Institute of TechnologyHepatosellüler karsinoma (HSK); dünya çapında en sık görülen beşinci kanser tipi olup kanser sebebiyle olan ölümlerin üçüncü sıradaki nedenidir. HSK ölümcül bir hastalık olup bu hastalığa sahip insanların 5 yıllık yaşam süreleri oranı % 0-14 gibi düşük bir orana sahiptir. HSK’da yaşam süresi teşhisten itibaren 6 ay gibi kısa bir süre olabilmektedir. Sorafenib ve diğer sinyal inhibitörleri gibi farmasötik ajanlar ve trans-arteriyal kemo-embolizasyon, perkütan etanol enjeksiyonu gibi yöntemler de hastalığın prognozunu iyileştirememektedir. Bu nedenle hepatosellüler karsinoma (HSK) tedavisinde kullanılabilecek yeni ajanların keşfi ve işleyiş mekanizmalarının belirlenmesi büyük önem taşımaktadır. Hücrelerdeki gen regülasyonunda DNA‘nın yanı sıra histon proteinlerinin epigenetik modifikasyonununda çok büyük bir önemi vardır. Epigenetik modifikasyonlardan birisi de histon asetilasyonudur ve hücre çoğalması, farklılaşması ve homeostas için gereklidir. Histon deastilazlar (HDAS); asetil gruplarını histon proteinlerinden ve histon olmayan bazı diğer proteinlerden uzaklaştırarak kromatinin yoğunlaşmasını ve transkripsiyonel represyonu sağlarlar. Bu süreçteki bozuklukların kansere sebep olabildiği ve pek çok kanser tipinde HDAS’ların aşırı ekspresyonu saptanmıştır. HDAS’ların aşırı aktivite göstermesiyle histonlardan asetil grupları uzaklaştırılıp tümör baskılayıcı genler eksprese edilememektedir. Hepatosellüler karsinoma’da HDAS’ların önemli bir rolü olduğu çok sayıda çalışmayla gösterilmiştir.Article Characterization of the Human Sialidase Neu4 Gene Promoter(TÜBİTAK - Türkiye Bilimsel ve Teknolojik Araştırma Kurumu, 2014) Seyrantepe, Volkan; Seyrantepe, Volkan; Delman, Murat; 04.03. Department of Molecular Biology and Genetics; 04. Faculty of Science; 01. Izmir Institute of TechnologyThere are 4 different sialidases that have been described in humans: lysosomal (Neu1), cytoplasmic (Neu2), plasma membrane (Neu3), and lysosomal/mitochondrial (Neu4). Previously, we have shown that Neu4 has a broad substrate specificity and is active against glyco-conjugates, including GM2 ganglioside, at the acidic pH of 3.2. An overexpression of Neu4 in transfected neuroglia cells from a Tay-Sachs patient shows a clearance of accumulated GM2, indicating the biological importance of Neu4. In this paper, we aimed to characterize a minimal promoter region of the human Neu4 gene in order to understand the molecular mechanism regulating its expression. We cloned 7 different DNA fragments from the human Neu4 promoter region into luciferase expression vectors for a reporter assay and also performed an electrophoretic mobility shift assay to demonstrate the binding of transcription factors. We demonstrated that -187 bp upstream of the Neu4 gene is a minimal promoter region for controlling transcription from the human Neu4 gene. The electrophoretic mobility shift assay showed that the minimal promoter region recruits a c-myc transcription factor, which might be responsible for regulation of Neu4 gene transcription. The data we obtained might be useful to discover small molecules, which control selective high expression of the human Neu4 gene, resulting in the normal morphological phenotype in the lysosomes of Tay-Sachs patients.