TR Dizin İndeksli Yayınlar / TR Dizin Indexed Publications Collection
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/7149
Browse
6 results
Search Results
Now showing 1 - 6 of 6
Article Effect of Substrate Concentration and Scale Up on the Polygalacturonase Production(Gıda Teknolojisi Derneği, 2019) Göğüş, Nihan; Tarı, CananPectinases have been used for many industrial applications since long time ago. The largest industrial application of these enzymes is in fruit juice and wine production for the extraction, filtration and clarification and for the maceration of fruits and vegetables. They work by enzymatic breaking down of the cell wall.In this study it was aimed to use the previously optimized shake flask media formulation in batch mode 1 L scale serial bioreactor system and 5 L scale in order to investigate the effects of substrate concentration and scale on PG activity and biomass production. In conclusion it was observed that average PG activity (101.29 U/ml) obtained in 5L scale bioreactor experiments was higher than the maximum PG activity (88.55 U/ml) at 40 g/L orange peel (OP) concentration obtained in the 1 L scale substrate concentration experiment. Furthermore,PG activity increased with an increase in substrate concentration except for 60 g/L orange peel concentration.Article The Relationship of Pellet Morphology To Polygalacturonase Production of Rhizopus Oryzae in Various Media Compositions(Gıda Teknolojisi Derneği, 2011) Tarı, Canan; Özkan, Kamer; Oncu, Şelale; Avcı, TubaBu çalışmada, ortam kompozisyonunu belirleyen değişik faktörlerin Rhizopus oryzae pellet morfolojisine ve poligalakturonaz (PG) enzimi üretimine olan etkisi incelenmiştir. En yüksek PG aktivitesine (11.53 U/ml) 4 mg/kg Zn+2 içeren, Mg+2 içermeyen ve pH 3 olan basal ortamında ulaşılmıştır. Karbon kaynağı olarak 14.78 g/l glukoz, 10 g/l galaktoz, 5 g/l mannoz, 0.5 g/l arabinoz ve 19.73 g/l ksilozun birlikte kullanılmıyla da en yüksek PG aktivitesine (27.94 U/ml) ulaşılmıştır. Mısır unu nitrojen kaynağı olarak PG sentezini tetiklemede oldukça etkili olup bir diğer yüksek tetikleyici olan mısır maserasyon sıvısı (CSL) ve $(NH _4)2SO _4$’den %33 daha fazla aktivite vermiştir. $(NH _4)2SO _4$ and 25 g/l glukoz içereren formulasyon ortalama çapı 1.25± 0.25 olan en fazla sayıda pellet oluşumunu sağlamıştır. Ortalama çapı 1.75±0.25 mm olan pelletlerin oluşumu ise yüksek glukoz konsantrasyonuna sahip (50g/l) maya ekstraktı içeren formulasyon ile elde edilmiştir. Uygun karbon kaynağının (glukoz) uygun nitrojen kaynağı (mısır unu) ile interaktif etkisi PG aktivitesini basal ortama göre 4 kat daha arttırmış, ortalama çapı 1.44±0.35mm olan pelletler oluşturmuştur.Article Aspergillus Sojae Tarafından Üretilen Poligalakturonazın Kısmi Saflaştırılması için Kromatografik Bir Yaklaşım(Sidas Medya Ajans Tanıtım Danışmanlık Ltd. Şti., 2017) Şen, İlknur; Mata-Gomez, Marco A.; Palomares, Marco Rito; Tarı, Canan; Dinç, MelikeBu çalışmanın amacı, A. sojae mutantından poligalakturonaz üretilmesi ve ham ekstraktın kromatografik yöntemlerle kısmi saflaştırılmasıdır. Peptitlerin konfirmasyonu için ilk basamak olarak, jel içinde sindirilmiş sodyum-dodesil-sülfatpoliakrilamid-jel-elektroforezi (SDS-PAGE) jellerinde matriks-yardımlı lazer desorpsiyon/iyonlaştırmalı-uçuş zamanlıkütle spektrometresi (Maldi-TOF MS) analizi yapılmıştır. Poligalakturonaz üretimi için, katı-faz ve derin fermentasyonlarda üç farklı karbon kaynağı kullanılmıştır. Ham ekstrakt ilk olarak iyon değişim kromatografisi (IEXC) ile saflaştırılmıştır ve ardından bunu boyut eleme kromatografisi izlemiştir. Derin [acı portakal kabuğu, şeker pancarı melası ve (NH4)2SO4] ve katı-faz (buğday kepeği, şeker pancarı ve HCl) fermentasyonlarından elde edilen ham ekstraktlar yüksek seviyede poligalakturonaz enzim aktivitesi (sırasıyla 95.22 and 50.27 U/mL) göstermiştir. IEXC toplanmış fraksiyonunun (180, 200 ve 220 mM tuz fraksiyonları) boyut elemesi, en yüksek verimi (%36) ve saflaştırma katını (2.00) göstermiştir. SDS-PAGE'den elde edilen olası poligalakturonaz bantları jel içinde sindirilmiş ve peptit konfirmasyonu için Maldi-TOF-MS ile analiz edilmiştir.Article Tarıma Dayalı Sanayi Atıklarının Katı Kültür Fermantasyonu ile Değerlendirilmesi: Sürece Etki Eden Faktörlere Genel Bakış(Gıda Teknolojisi Derneği, 2015) Demir, Hande; Tarı, CananKatı-kültür fermantasyonu (KKF) batı ülkelerinin son yıllarda ilgisini çekmiş olan fakat doğu ülkeleri tarafından çok eski zamanlardan beri kullanılagelen bir teknolojidir. KKF, mühendislik ve çevresel açıdan bakıldığında birçok ürün ve biyolojik işlemin gelişimi için uygun bir yöntem olmakla birlikte, hâlihazırda derin kültür fermantasyonu ile rekabeti devam etmektedir. Bu derleme makalede KKF’nin tanımı, kısa tarihçesi, tarıma dayalı sanayi atık kullanımının avantajları ve kısıtları ile birlikte inert yataklar hakkında bilgi verilmektedir. Derlemenin önemli bir bölümünde ise inokülüm oranı, inkübasyon süre ve sıcaklığı, nem içeriği ve su aktivitesi, başlangıç pH’ı, parçacık büyüklüğü, karıştırma ve inokülüm türü gibi KKF işlemlerini etkileyen etkenler özetlenmiştir. Her bir etkenin KKF işlemleri üzerindeki etkisi teorik olarak detaylandırılmakla kalmayıp, aynı zamanda literatürde yer alan çalışmalar yardımıyla da tartışılmıştır. Bu makale KKF işlemleriyle ilgilenen araştırmacılara ışık tutacağı gibi tarıma dayalı sanayi atıklarına katma değer kazandırılması konusunda da üreticilere yol gösterecektir.Article Citation - WoS: 13Citation - Scopus: 14Evaluation of Orange Peel, an Industrial Waste, for the Production of Aspergillus Sojae Polygalacturonase Considering Both Morphology and Rheology Effects(TUBITAK, 2014) Gögüş, Nihan; Hakgüder Taze, Bengi; Demir, Hande; Tarı, Canan; Ünlütürk, Sevcan; Lahore, Marcelo FernandezOrange peel is an agroindustrial waste rich in pectin and known to be an inducer for pectinase production. The use of this low-cost substrate for the production of an industrially important enzyme, polygalacturonase (PG), can be an alternative way to turn this waste into a value-added product, contributing to the reduction of environmental waste disposal problems. Enzyme productions by fungal microorganisms are affected by environmental and nutritional factors, demanding the determination of optimum conditions for maximum enzyme production with the desired fungal morphology and broth rheology. Therefore, complex and additional carbon sources were optimized with respect to PG production by Aspergillus sojae using statistical approaches. Effect of pH, another significant parameter affecting the rheology and morphology of the strain, was investigated in the serial bioreactor system using the optimized medium composition. Highest PG enzyme yield and productivity together with the maximum PG enzyme production (93.48 U/mL) were obtained under uncontrolled pH conditions. Under these conditions, morphologically, pellet sizes exhibited a normal distribution ranging between 0.5-1.0 mm and 1.0-1.5 mm, and rheological measurements revealed that fermentation broths showed non-Newtonian flow. The low pH trend observed during the course of the fermentation was another important positive outcome for industrial fermentations, prone to contamination problems.Article Citation - WoS: 28Citation - Scopus: 32Optimization of the Process Parameters for the Utilization of Orange Peel To Produce Polygalacturonase by Solid-State Fermentation From an Aspergillus Sojae Mutant Strain(TUBITAK, 2012) Demir, Hande; Göğüş, Nihan; Tarı, Canan; Heerd, Doreen; Lahore, Marcelo FernandezThe effect of orange peel concentration, HCl concentration, incubation time and temperature, and inoculum size on the spore count and activity of polygalacturonase (PG) enzyme produced from Aspergillus sojae M3 by solidstate fermentation was screened using 2k factorial design. Orange peel and HCl concentrations and incubation time were significant factors affecting the responses. Optimum conditions favoring both PG and spore production from Aspergillus sojae M3 were determined as 2% orange peel and 50 mM HCl concentrations at 22 °C and 4.3 days of incubation. An overlay plot was constructed for use as a practical chart for production of high enzyme activity (>35.0 U/g substrate) and spore count (9.0 × 108 to 2.0 × 109 spore/mL) by superimposing the contours of PG activity and spore count responses. The accuracy and reliability of the constructed models on the responses was validated with the maximum calculated error rate between the predicted and actual activities at 14.1% and 22.4%, respectively. © TÜBİTAK.