Phd Degree / Doktora
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/2869
Browse
381 results
Search Results
Doctoral Thesis Potential of Lactic Acid Bacteria To Produce Functional Fermented Whey With Putative Antihypertensive Properties : Enrichment Ofangiotensin–i Converting Enzyme (ace)– Inhibitory Peptides and Gamma–aminobutyric Acid (gaba)(Izmir Institute of Technology, 2023) Ağırbaşlı, Zeynep; Harsa, Hayri̇ye Şebnem; Sezgi̇n, EfeBu tez Laktik Asit Bakterileri koleksiyonunun (LAB) antihipertansif yetenek potensiyallerinin değerlendirilmesine ve fermente peynir altı suyu içecek bazlarının geliştirişmesine odaklanmıştır. Bu amaçla, 400 adetten fazla LAB proteolitik aktiviteleri açısından farklı yağsız süt ortamlarında taranmıştır. LAB'lar arasında 39 adedi yüksek proteolitik olarak tespit edilmiştir. Fermente sütleri üretmek için suşlar seçilmiştir, 34 en yüksek ACE inhibitor aktiviteli LAB'dan 13 tanesi Lactobacillus brevis D9 and Lactococcus lactis ssp. lactis C24 ile ikili kültürlü fermente peynir altı suyu bazı oluşturmak üzere kullanılmıştır. Fermente sütlerdeki proteolitik aktivite ve ACE inhibitor aktivite of 4.11-1.8 mg/L Lösin ve %49–86 aktivite olarak sırasıyla tespit edilmiştir. İkili kültür fermente peynier altı suyu bazlarında ACE inhibitör aktiviteler %80-97 aralığında bulunmuştur. Seçilen 11 LAB'ın fermentasyon surasındaki proteolitik aktiviteleri HPLC ve SDS-PAGE analizi ile peynir altı suyu proteinlerinin degredasyon profilleri ile değerlendirilmiştir. 300 LAB arasından modifiye sıvı besiyerinde 37 veya 42 C'de 48 saat inkübasyon sonrası 33 suş GABA üretim kapasitesi gösterdiği ince tabaka kromatografisi (TLC) ile gözlemlenmiştir. Fermente whey içeceği bazı feliştirmek için 10 LAB türü, örneğin Lactiplantibacillus plantarum, Latilactobacillus curvatus and Levilactobacillus brevis, modifiye sıvı besiyerinde 50–367 mg/L konsantrasyonlarında verim göstermesi nedeniyle seçilmiştir. Buna göre, fermente peynir altı suyu bazlarında 24 saat 37 °C sonrası GABA konsantrasyonları 11–21mg/L aralığında hesaplanmıştır.Doctoral Thesis An Inquiry Into Architectural Space in Computational Design Practice(Izmir Institute of Technology, 2023) Öztürk, Kadi̇r; Doğan, Fehmi̇; Kasalı, AltuğÇağdaş mimari uygulama ve araştırmalarında başat temalardan biri olan sayısal tasarım, mekana ilişkin düşünme biçimimizde köklü değişikliklere yol açmıştır. Sayısal tasarım uygulamaları, mimarlık üretiminde giderek daha baskın hale gelse de mekan hakkında düşünme ve hayal etme biçimimizdeki yansımalarına yönelik derinlemesine çalışmalar hala gerekmektedir. Bu araştırma, sayısal tasarım uygulamaları ile birlikte mekanı kavramsallaştırma biçimimizde yaşanan değişiklikleri sorgulayarak modern mekan anlayışımıza ilişkin nelerin korunduğunu, uyarlandığını veya ihmal edildiğini tartışır. Sunulan çalışma ile sayısal tasarım araçlarını kullanan deneyimli uygulayıcılarla gerçekleştirilen görüşmeler üzerinden mekanla ilgili kavramsallaştırmaların farklı boyutlarının anlaşılması amaçlanmaktadır. Görüşmelerden elde edilen veriler nitel tematik inceleme yöntemiyle analiz edilmiştir. Bu araştırma iki ana soru etrafında şekillenmektedir. Hesaplamalı tasarım pratiğinde mimari mekan nasıl hayal edilir? Prosedürlerin kesin, tanımlayıcı ve kurala dayalı olduğu hesaplamalı tasarım yaklaşımlarında mimari mekan çok katmanlı, tanımlanması ve ifade edilmesi zor bir kavram olarak nasıl ele alınır? Mimari kelime dağarcığına aktarılan sayısal terminoloji, tasarımcıların sadece sözlü ifadelerine değil, aynı zamanda mimari mekan hakkındaki düşüncelerine de hakim olmaktadır. Sayısal tasarım araçlarının, tasarımcıların göz önünde bulundurdukları parametrelerin yanı sıra mekanı hayal ederken onların düşünme biçimleri üzerinde de etkisi olduğu tartışılmaktadır. Buradaki varsayım, birden fazla katman ve anlam barındıran bir kavram olarak mekanın hesaplanabilir değişkenlerinin yanında hesaplanamaz yönleri de olduğu ve sayısal tasarım pratiğinin bu iki yönü nasıl ele aldığını araştırmanın keşfetmeye değer olduğudur. Sayısal düşünce, mekanın ölçülebilir yönlerini düşünmek ve temsil etmek için uygun bir ortam sağlarken, mekanın tarif edilemez ve belirsiz yönleri de hesaplanabilir olanın sınırlarını ortaya çıkarabilir. Mekan kavramının sayısal tasarım teknolojileriyle nasıl yeniden düşünüldüğüne ilişkin bulgular irdelenmeye değerdir.Doctoral Thesis Distributed Expertise of Computational Practices in Architectural Design Teams(Izmir Institute of Technology, 2023) Erbil Altıntaş, Livanur; Kasalı, Altuğ; Doğan, Fehmi̇; Kasalı, AltuğBu çalışma, bilginin farklı beceri ve bilgi tabanlarına sahip katılımcılar arasında nasıl üretildiğine ve dağıtıldığına, bilginin tasarımcılar, araçlar ve temsiller aracılığıyla her ekip üyesinin rolünü ve görevlerini tanımlamak için nasıl iletildiğine ve odaklanılan bilişsel sistem içindeki etkileşimlerin doğasına odaklanmaktadır. Tez, etnografik yöntemler kullanarak mimari tasarımda hesaplama araçlarını içeren durumları keşfeder ve dağıtılmış bir bilişsel sistemin tasarım ekipleri içinde çok disiplinli işbirliğini nasıl kolaylaştırdığını anlamaya odaklanır. Araştırmanın bir yönü, tasarımcıların işbirliği ortamında hesaplamalı tasarım araçlarını nasıl kullandığını inceler ve bu araçların tesadüfi tasarım keşiflerini nasıl sağladığını anlamayı amaçlar. Ekibin tasarım çözümünü geliştirme süreçlerini ve tesadüf keşifleri nasıl yönettiğini, özellikle sistemde keşif yapıcı bir ortamda birden fazla alternatifin nasıl üretildiğini ve bu durumun keşfin derecesini nasıl etkilediği sunar. İkinci olarak tez, hesaplamalı tasarım uygulamalarında alternatif tasarım seçeneklerinin oluşturulmasını ve değerlendirilmesini ele alır. Ofis ve ekip liderleri, tasarım fikrini ve sürecini ekip katılımcıları, müşteriler ve danışmanlar için daha okunabilir ve şeffaf hale getirmede önemli bir rol oynarlar. Çalışma, tasarım fikirlerinin dağıtılmış bilişsel sistem içinde nasıl temsil edildiğini ve dışa vurulduğunu inceleyerek tasarım sürecini anlamayı amaçlar. Farklı alanlarda uzmanlaşan ekip katılımcıları arasında tasarım sürecinin şeffaflığı ile birlikte doğaçlama yapabilecekleri alanı tanımak önemlidir. Üçüncü olarak, bu çalışma mimari tasarımda hesaplamalı tasarım araçlarının çeşitli yönlerini ve dağıtılmış bilişsel sistemler içinde işbirlikçi süreçlere olan etkilerini inceler. Multidisipliner ekip katılımcıları arasındaki etkileşimleri ve hem dijital hem de dijital olmayan araçların rolünü inceleyerek, çok disiplinli tasarım ekiplerinin tasarım süreçlerini nasıl yönlendirdiğine dair bulgular sunar.Doctoral Thesis Evaluation of Different Urban Transformation Strategies Through Effectiveness Indicators in Earthquake-Prone Areas(Izmir Institute of Technology, 2023) Bozkurt, Uğur; Veli̇beyoğlu, KorayTürkiye gibi gelişmekte olan ülkelerde afet riski altındaki alanların kentsel dayanıklılığını artırmak için öncelikle fiziksel yapının afet risklerini azaltırken sürdürülebilir kalkınmayı sağlamak gerekmektedir. Bu bağlamda Fiziksel, Ekonomik, Sosyal, Çevresel, Yasal ve Kurumsal, Planlama ve Tasarım ile Teknolojik gibi birçok kategoride önemli sorunlar bulunmaktadır. Ancak bu tez kapsamında, kentsel dönüşüm stratejilerinin belirlenmesinde yaşanan karar verme sorununa odaklanılmıştır. Bu bağlamda amaç, afet riskli alanlarda kentsel dönüşümden sorumlu kurumların kullanabileceği Çok Kriterli Karar Verme Yöntemlerine dayalı bir karar verme modeli geliştirmek ve modelin çalışma sürecine ilişkin bir pilot çalışma gerçekleştirmektir. Bu amaçla, literatürde, mevzuatta ve kentsel dönüşüm pratiğinde yer alan üç yüz adet gösterge/kriter ile tez kapsamında belirlenen beş adet kentsel dönüşüm sürecine [(1) Bütüncül Kentsel Dönüşüm ve Uygulama Modeli, (2) Bütüncül Kentsel Dönüşüm ve Parçalar Halinde Uygulama Modeli, (3) Parçacıl Kentsel Dönüşüm ve Uygulama Modeli, (4) Önemli Yatırımların Mevcut Yapıya Eklenmesi Modeli, (5) Parsel Bazlı Kentsel Dönüşüm Modeli] ilişkin karar alternatifi tipolojisi kullanılarak bu araştırma sonuçları test edilmiştir. Bu değerlendirme için kurumlarla anket çalışması yapılarak gösterge sayısı azaltılmış ve Aktepe-Emrez Mahalleleri Kentsel Dönüşüm Projesi kapsamında bir vaka çalışması yapılarak anketin analizinin sonrasında kritik göstergeler olarak belirlenen yirmi adet gösterge ilgili birimlerin yetkilileri ile test edilmiş ve sonuçlar değerlendirilmiştir. Microsoft Excel Programı üzerinde geliştirilen kriter ağırlıklarının belirlenmesine dayalı DEMATEL ve ENTROPI yöntemleri ile karar alternatiflerinin sıralanmasına dayalı PROMETHEE ve COPRAS yöntemleri kullanılarak geliştirilen INTEMUS yönteminin, kentsel dönüşümden sorumlu kurumlar tarafından uygulanabilecek bir karar verme yöntemi olarak kullanılması amaçlanmaktadır.Doctoral Thesis Exactly Solvable Quantum Parametric Oscillators in Higher Dimensions(Izmir Institute of Technology, 2022) Çayiç, Zehra; Atılgan Büyükaşık, ŞirinThe purpose of this thesis is to study the dynamics of the generalized quantum parametric oscillators in one and higher dimensions and present exactly solvable models. First, time-evolution of the nonclassical states for a one-dimensional quantum parametric oscillator corresponding to the most general quadratic Hamiltonian is found explicitly, and the squeezing properties of the wave packets are analyzed. Then, initial boundary value problems for the generalized quantum parametric oscillator with Dirichlet and Robin boundary conditions imposed at a moving boundary are introduced. Solutions corresponding to different types of initial data and homogeneous boundary conditions are found to examine the influence of the moving boundaries. Besides, an N-dimensional generalized quantum harmonic oscillator with time-dependent parameters is considered and its solution is obtained by using the evolution operator method. Exactly solvable quantum models are introduced and for each model, the squeezing and displacement properties of the time-evolved coherent states are studied. Finally, time-dependent Schrödinger equation describing a generalized two-dimensional quantum coupled parametric oscillator in the presence of time-variable external fields is solved using the evolution operator method. The propagator and time-evolution of eigenstates and coherent states are derived explicitly in terms of solutions to the corresponding system of coupled classical equations of motion. In addition, a Cauchy-Euler type quantum oscillator with increasing mass and decreasing frequency in time-dependent magnetic and electric fields is introduced. Based on the explicit results, squeezing properties of the wave packets and their trajectories in the two-dimensional configuration space are discussed according to the influence of the time-variable parameters and external fields.Doctoral Thesis Parametric Flow Simulation for Early Design Phase: Case Study of an Urban Regeneration Area in Izmir(Izmir Institute of Technology, 2022) Öner, Efe; Başaran, TahsinClimate change and its effects on the planning of cities require new dynamics for designing new expansion zones or neighborhood development projects. In conceptual phases, decision-makers, architects, planners, and engineers must consider extreme weather events and increased wind speeds in cities due to climate change to ensure the safety of pedestrians. Proposed building layouts, geometrical parameters, and features should be investigated in an artificial environment to satisfy wind behavior for acceptable conditions. Computational Fluid Dynamics (CFD) software provides insight into wind effects on the pedestrian level for the proposed layout of buildings and the surrounding area. This insight can boost the design process without conducting experimental wind tunnel tests. This study aims to assess the impact of building geometry (height, width, length) and building spacings in urban development projects for the safety and comfort of users in pedestrian-level wind environments with CFD simulations. The case area of this study is the first phase of an urban regeneration area in Izmir. The proposed layout is analyzed with prevailing wind speeds and directions to identify the dangerous and comfortable regions around buildings. Sub-configurations of buildings are simulated in CFD software to compare with existing wind tunnel tests for verification and validation. A design proposal with building features is evaluated with validated CFD parameters to examine the impact on pedestrian-level wind speeds. Mean speeds for corresponding comfort and safety limits of categorized human activities are compared to findings to identify suitable locations for these activities around buildings. Design parameters of urban layout; distance between buildings, height, and balconies on facades showed significant effects on pedestrian level wind environment. Building height among these parameters proved to be a decisive feature that should be considered in the early design stages.Doctoral Thesis Krull-Schmidt Properties Over Non-Noetherian Rings(Izmir Institute of Technology, 2022) Gürbüz, Ezgi; Ay Saylam, BaşakLet R be a commutative ring and C a class of indecomposable R-modules. The Krull-Schmidt property holds for C if, whenever G1 ⊕ ·· · ⊕ Gn H1 ⊕ ·· · ⊕ Hm for Gi, Hj ∈ C, then n = m and, after reindexing, Gi Hi for all i ≤ n. The main purpose of this thesis is to investigate Krull-Schmidt properties of certain classes of modules over Non-Noetherian rings. Particularly weakly Matlis domains, strong Mori domains and Marot rings, all of which are among the class of Non-Noetherian rings, are studied. wweak isomorphism types are defined and the conditions when they coincide for torsionless modules over weakly Matlis domains are discussed. With the help of this comparison, the Krull-Schmidt property of w-ideals of a strong Mori domain is characterized. Also, the same property for overrings of a strong Mori domain is examined. Some useful results for a Marot ring with ascending condition on its regular ideals are obtained. Krull-Schmidt property on regular ideals of such a ring is studied and a characterization is given. Furthermore, the same property is discussed for overrings of a Marot ring.Doctoral Thesis Frequent Subgraph Mining Over Dynamic Graphs(Izmir Institute of Technology, 2022) Abuzayed, Nourhan N. I.; Ergenç Bostanoğlu, BelginFrequent subgraph mining (FSM) is an essential and challenging graph mining task used in several applications. Modern applications employ evolving graphs, so FSM is more challenging with evolving graphs due to the streaming nature of the input, and the exponential time complexity of the algorithms. Sampling schemes are used if approximate results serve the purpose. This thesis introduces three approximate frequent subgraph mining algorithms in evolving graphs. those algorithms use novel controlled reservoir sampling. A sample reservoir of the evolving graph and an auxiliary heap reservoir data structure are kept together in a fixed sized reservoir. When the whole reservoir is full, and space has required the edges of lower degree or higher nodes are deleted. This selection is done by utilizing the heap data structure as a heap reservoir, which keeps the node degrees. By keeping the edges of higher degree nodes in the sample reservoir, accuracy is maximized without sacrificing time and space, in contrast, keeping the edges of lower degree nodes in the sample reservoir, accuracy is minimized with higher time and space. The first algorithm is Controlled Reservoir Sampling with Unlimited heap size (UCRS), where the used heap reservoir size is unlimited. The second algorithm is Controlled Reservoir Sampling with Limited heap size (LCRS). It is a modified version of UCRS, but the heap reservoir size is limited, as a result; sample reservoir size in the whole reservoir increases since the total number of nodes dedicated for the whole reservoir includes the nodes of the heap reservoir also. The third algorithm is Maximum Controlled Reservoir Sampling (MCRS). It is a modified version of UCRS, but the candidate edge for deletion is an edge with maximum node degrees. Experimental evaluations to measure scalability and recall performances of the three algorithms in comparison to state of art algorithms are performed on dense and sparse evolving graphs. Findings show that UCRS and LCRS algorithms are scalable and achieve better recall than edge based reservoir algorithms. LCRS achieves the best recall in comparison to edge or subgraph based reservoir algorithms. MCRS has the worst speed-up and recall among the other proposed and competitor algorithms.Doctoral Thesis When Certain Relative Projectivity and Injectivity Conditions Imply the Global Projectivity and Injectivity(Izmir Institute of Technology, 2022) Benli Göral, Sinem; Büyükaşık, EnginA right R-module M is called R-projective provided that it is projective relative to the right R-module RR. One of the parts of this thesis deals with the rings whose all nonsingular right modules are R-projective. For a right nonsingular ring R, we prove that RR is of finite Goldie rank and all nonsingular right R-modules are R-projective if and only if R is right finitely Σ-CS and flat right R-modules are R-projective. Then, R-projectivity of the class of nonsingular injective right modules is also considered. Over right nonsingular rings of finite right Goldie rank, it is shown that R-projectivity of nonsingular injective right modules is equivalent to R-projectivity of the injective hull E(RR). As a second goal, we deal with simple-injective modules. For a right module M, we prove that M is simple-injective if and only if M is min-N-injective for every cyclic right module N. The rings whose simple-injective right modules are injective are exactly the right Artinian rings. A right Noetherian ring is right Artinian if and only if every cyclic simple-injective right module is injective. The ring is quasi-Frobenius if and only if simple-injective right modules are projective. For a commutative Noetherian ring R, we prove that every finitely generated simple-injective R-module is projective if and only if R = A × B, where A is quasi-Frobenius and B is hereditary. An abelian group is simpleinjective if and only if its torsion part is injective.Doctoral Thesis Synthesis and Characterization of Novel Organometallic-Semicondutor Nanocomposit Photoelectrodes(Izmir Institute of Technology, 2022) Göl, Yusuf Emre; Karabudak, Engin; Karabudak, EnginStudies on novel electrochemical catalyst synthesis for efficient oxygen evolution reaction (OER) attract the attention of researchers. In general, changing of synthesis method and the doping metal affect the electrochemical activities of BSCF. In this work, silver doped Ba0.5Sr0.5Co0.8Fe0.2O3-δ (BSCF-Ag) perovskite structure is shown to be a better electrocatalyst for oxygen evolution reaction (OER) due to its lower overpotential and extended durability. BSCF structure was synthesized by the EDTA-citric acid method. Appropriate amount of Ba(NO3)2 and EDTA were dissolved 0.1 M NH4OH solution. Nitrate salts of other metals were dissolved in distilled water, then mixed with prepared Ba(NO3)2 solution. The mixture was stirred at 70 °C until gelation occurred. The gelled samples obtained were baked in a drying oven at 250 °C for 24 h before being calcined at 1000 °C for 12 h. To achieve a current density of 10 mA cm−2, BSCF-Ag has required an overpotential of 0.36 V, which is very low compared to BSCF. To determine the stability of BSCF-Ag, continuous chronopotentiometry tests were carried out for 5 h and at a constant current density of 10 mA cm−2. BSCF-Ag was characterized by XRD, SEM, and XPS. Recent advances in inkjet printing technology for applications relating to heterogeneous catalysis are presented. Catalysts lie at the heart of most chemical reactions where raw materials are converted to value-added products. Therefore, synthesis and immobilization of active catalysts in the reactor are of great importance. Inkjet printing is an additive manufacturing technology introduced recently as a useful method for the fabrication and application of catalysts as a class of functional materials. Inkjet printing provides special features which can be tailored to the design of high-efficient catalytic processes. This thesis presents an overview of the technology along with developments and challenges associated with the combination of inkjet printing and heterogeneous catalysis, such as ink preparation, thin-film properties and real-life applications.