Phd Degree / Doktora
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/2869
Browse
361 results
Search Results
Now showing 1 - 10 of 361
Doctoral Thesis Potential of Lactic Acid Bacteria To Produce Functional Fermented Whey With Putative Antihypertensive Properties : Enrichment Ofangiotensin–i Converting Enzyme (ace)– Inhibitory Peptides and Gamma–aminobutyric Acid (gaba)(Izmir Institute of Technology, 2023) Ağırbaşlı, Zeynep; Harsa, Hayri̇ye Şebnem; Sezgi̇n, EfeBu tez Laktik Asit Bakterileri koleksiyonunun (LAB) antihipertansif yetenek potensiyallerinin değerlendirilmesine ve fermente peynir altı suyu içecek bazlarının geliştirişmesine odaklanmıştır. Bu amaçla, 400 adetten fazla LAB proteolitik aktiviteleri açısından farklı yağsız süt ortamlarında taranmıştır. LAB'lar arasında 39 adedi yüksek proteolitik olarak tespit edilmiştir. Fermente sütleri üretmek için suşlar seçilmiştir, 34 en yüksek ACE inhibitor aktiviteli LAB'dan 13 tanesi Lactobacillus brevis D9 and Lactococcus lactis ssp. lactis C24 ile ikili kültürlü fermente peynir altı suyu bazı oluşturmak üzere kullanılmıştır. Fermente sütlerdeki proteolitik aktivite ve ACE inhibitor aktivite of 4.11-1.8 mg/L Lösin ve %49–86 aktivite olarak sırasıyla tespit edilmiştir. İkili kültür fermente peynier altı suyu bazlarında ACE inhibitör aktiviteler %80-97 aralığında bulunmuştur. Seçilen 11 LAB'ın fermentasyon surasındaki proteolitik aktiviteleri HPLC ve SDS-PAGE analizi ile peynir altı suyu proteinlerinin degredasyon profilleri ile değerlendirilmiştir. 300 LAB arasından modifiye sıvı besiyerinde 37 veya 42 C'de 48 saat inkübasyon sonrası 33 suş GABA üretim kapasitesi gösterdiği ince tabaka kromatografisi (TLC) ile gözlemlenmiştir. Fermente whey içeceği bazı feliştirmek için 10 LAB türü, örneğin Lactiplantibacillus plantarum, Latilactobacillus curvatus and Levilactobacillus brevis, modifiye sıvı besiyerinde 50–367 mg/L konsantrasyonlarında verim göstermesi nedeniyle seçilmiştir. Buna göre, fermente peynir altı suyu bazlarında 24 saat 37 °C sonrası GABA konsantrasyonları 11–21mg/L aralığında hesaplanmıştır.Doctoral Thesis An Inquiry Into Architectural Space in Computational Design Practice(Izmir Institute of Technology, 2023) Öztürk, Kadi̇r; Doğan, Fehmi̇; Kasalı, AltuğÇağdaş mimari uygulama ve araştırmalarında başat temalardan biri olan sayısal tasarım, mekana ilişkin düşünme biçimimizde köklü değişikliklere yol açmıştır. Sayısal tasarım uygulamaları, mimarlık üretiminde giderek daha baskın hale gelse de mekan hakkında düşünme ve hayal etme biçimimizdeki yansımalarına yönelik derinlemesine çalışmalar hala gerekmektedir. Bu araştırma, sayısal tasarım uygulamaları ile birlikte mekanı kavramsallaştırma biçimimizde yaşanan değişiklikleri sorgulayarak modern mekan anlayışımıza ilişkin nelerin korunduğunu, uyarlandığını veya ihmal edildiğini tartışır. Sunulan çalışma ile sayısal tasarım araçlarını kullanan deneyimli uygulayıcılarla gerçekleştirilen görüşmeler üzerinden mekanla ilgili kavramsallaştırmaların farklı boyutlarının anlaşılması amaçlanmaktadır. Görüşmelerden elde edilen veriler nitel tematik inceleme yöntemiyle analiz edilmiştir. Bu araştırma iki ana soru etrafında şekillenmektedir. Hesaplamalı tasarım pratiğinde mimari mekan nasıl hayal edilir? Prosedürlerin kesin, tanımlayıcı ve kurala dayalı olduğu hesaplamalı tasarım yaklaşımlarında mimari mekan çok katmanlı, tanımlanması ve ifade edilmesi zor bir kavram olarak nasıl ele alınır? Mimari kelime dağarcığına aktarılan sayısal terminoloji, tasarımcıların sadece sözlü ifadelerine değil, aynı zamanda mimari mekan hakkındaki düşüncelerine de hakim olmaktadır. Sayısal tasarım araçlarının, tasarımcıların göz önünde bulundurdukları parametrelerin yanı sıra mekanı hayal ederken onların düşünme biçimleri üzerinde de etkisi olduğu tartışılmaktadır. Buradaki varsayım, birden fazla katman ve anlam barındıran bir kavram olarak mekanın hesaplanabilir değişkenlerinin yanında hesaplanamaz yönleri de olduğu ve sayısal tasarım pratiğinin bu iki yönü nasıl ele aldığını araştırmanın keşfetmeye değer olduğudur. Sayısal düşünce, mekanın ölçülebilir yönlerini düşünmek ve temsil etmek için uygun bir ortam sağlarken, mekanın tarif edilemez ve belirsiz yönleri de hesaplanabilir olanın sınırlarını ortaya çıkarabilir. Mekan kavramının sayısal tasarım teknolojileriyle nasıl yeniden düşünüldüğüne ilişkin bulgular irdelenmeye değerdir.Doctoral Thesis Evaluation of Different Urban Transformation Strategies Through Effectiveness Indicators in Earthquake-Prone Areas(Izmir Institute of Technology, 2023) Bozkurt, Uğur; Veli̇beyoğlu, KorayTürkiye gibi gelişmekte olan ülkelerde afet riski altındaki alanların kentsel dayanıklılığını artırmak için öncelikle fiziksel yapının afet risklerini azaltırken sürdürülebilir kalkınmayı sağlamak gerekmektedir. Bu bağlamda Fiziksel, Ekonomik, Sosyal, Çevresel, Yasal ve Kurumsal, Planlama ve Tasarım ile Teknolojik gibi birçok kategoride önemli sorunlar bulunmaktadır. Ancak bu tez kapsamında, kentsel dönüşüm stratejilerinin belirlenmesinde yaşanan karar verme sorununa odaklanılmıştır. Bu bağlamda amaç, afet riskli alanlarda kentsel dönüşümden sorumlu kurumların kullanabileceği Çok Kriterli Karar Verme Yöntemlerine dayalı bir karar verme modeli geliştirmek ve modelin çalışma sürecine ilişkin bir pilot çalışma gerçekleştirmektir. Bu amaçla, literatürde, mevzuatta ve kentsel dönüşüm pratiğinde yer alan üç yüz adet gösterge/kriter ile tez kapsamında belirlenen beş adet kentsel dönüşüm sürecine [(1) Bütüncül Kentsel Dönüşüm ve Uygulama Modeli, (2) Bütüncül Kentsel Dönüşüm ve Parçalar Halinde Uygulama Modeli, (3) Parçacıl Kentsel Dönüşüm ve Uygulama Modeli, (4) Önemli Yatırımların Mevcut Yapıya Eklenmesi Modeli, (5) Parsel Bazlı Kentsel Dönüşüm Modeli] ilişkin karar alternatifi tipolojisi kullanılarak bu araştırma sonuçları test edilmiştir. Bu değerlendirme için kurumlarla anket çalışması yapılarak gösterge sayısı azaltılmış ve Aktepe-Emrez Mahalleleri Kentsel Dönüşüm Projesi kapsamında bir vaka çalışması yapılarak anketin analizinin sonrasında kritik göstergeler olarak belirlenen yirmi adet gösterge ilgili birimlerin yetkilileri ile test edilmiş ve sonuçlar değerlendirilmiştir. Microsoft Excel Programı üzerinde geliştirilen kriter ağırlıklarının belirlenmesine dayalı DEMATEL ve ENTROPI yöntemleri ile karar alternatiflerinin sıralanmasına dayalı PROMETHEE ve COPRAS yöntemleri kullanılarak geliştirilen INTEMUS yönteminin, kentsel dönüşümden sorumlu kurumlar tarafından uygulanabilecek bir karar verme yöntemi olarak kullanılması amaçlanmaktadır.Doctoral Thesis Depth Based Calibration of Multiple Rgbd Cameras for Full 3d Reconstruction(Izmir Institute of Technology, 2023) Tunçer Çalı, Esra; Gümüşteki̇n, ŞevketBu tezde, yalnızca derinlik görüntülerinin kullanıldığı, çoklu derinlik kamerası ile çalışabilen yeni bir derinlik kamerası kalibrasyon tekniği geliştirilmiştir. Çoğu çalışmada, düzlemsel bir dama tahtası desenli objenin IR görüntüleri kullanılarak derinlik kamerası kalibrasyonu yapılmış ve elde edilen parametreler derinlik kamerası parametreleri olarak kabul edilmiştir. Bu yaklaşım yıllardır geliştirilen geleneksel metotlarla kullanılabildiği için pratik bir çözüm olarak düşünülmektedir. Ancak bu yaklaşım derinlik değerlerinden faydalanmamakta ve 3D'de yanlış eşleşmelere neden olan kalibrasyon hatalarına yol açmaktadır. Bu hataları gidermek için yinelemeli en yakın nokta metodu gibi ek tamamlayıcı metotlar uygulansa dahi düşük hatalı eşleşme sonuçları elde edilememektedir. Çözüm olarak 3 boyutlu, 4 eş-yarıçaplı küresi olan dört üçgen yüzlü yapıda bir kalibrasyon objesi tasarlanmış ve kürelerin merkezlerini derinlik görüntüsü üzerinden tespit edebilmek için elips temelli yeni bir metot geliştirilmiştir. Küre merkezleri ve derinlik hatası giderilen derinlik değerleri kullanılarak projeksiyon matris metodu orijinalinden farklı olarak 6 yerine 4 eşleşme noktası ihtiyacı olacak şekilde iyileştirilmiştir. Derinlik değerlerini geleneksel ışın demeti düzenleme (bundle adjustment-BA) metoduna dahil eden ve yeniden-projeksiyon hatasını 3B'de hesaplayan iki yeni parametre kestirme metodu dört derinlik kamerasının içsel ve dışsal parametrelerini bir arada kestirebilmek için geliştirilmiştir. Dama tahtası desenli objenin IR görüntülerinin kullanıldığı kalibrasyona kıyasla, önerilen metotlar ile elde edilen hata ortalamaları önemli ölçüde düşürülmüştür. Bu tezde geliştirilen metotlar derinlik ölçümü için kullanılan teknolojiden bağımsız oldukları için tüm derinlik kameralarında çalışabilmektedirler.Doctoral Thesis Photonic Crystal Textiles(Izmir Institute of Technology, 2022) Çetin, Zebih; Sözüer, Hüseyin SamiPhotonic crystals are man-made structures that can be used to manipulate the flow of light. They are classified as one-, two- and three-dimensional photonic crystals according to the periodic variation of the dielectric profile in space. Apart from artificial photonic crystals there are numerous examples of naturally occurring photonic crystals which have evolved mostly for structural coloration, such as wings of butterflies, natural opal gem stone, peacock feathers to name a few. Using photonic crystal structures the propagation of electromagnetic waves can entirely be prohibited by means of photonic band gap. Considering the fact that approximately two thirds of the heat loss of the human body occurs through electromagnetic radiation with a wavelength around 10 microns, it becomes important to consider photonic crystals for the purpose of reducing heat loss in textiles. We observe that the textile, by virtue of the fact that it has been produced by weaving, already has a periodic structure, and thus is a potential candidate for a photonic crystal. With the right fiber that the textile is woven and the right weave pattern, the textile itself would be a photonic crystal. The most common weave patterns used in the textile industry are plain weave, basket weave, dutch weave and twill weave. In this thesis, we used the finite-difference time-domain method to search for the optimum weave pattern to minimize heat loss by the human body.Doctoral Thesis Determination of Vitamin D by Sensor Technologies Based on Molecular Imprinted Polymers(Izmir Institute of Technology, 2022) Ölçer, Yekta Arya; Eroğlu, Ahmet Emin; Demir, Mustafa MuammerVitamin D is an essential nutrient in the body; it plays important roles in human health. Both its lack and excess can have health risks. As a consequence, there is a great demand for development of simple and precise detection methods for vitamin D derivatives in different samples. Molecular imprinting polymers (MIPs) are artificial receptors that can recognize target molecules in solution. In this study, two different polymerization techniques were used to obtain MIP/NIP sorbents/films for the detection of vitamin D3. Firstly, molecular imprinted solid phase extraction (MISPE) method was proposed prior to HPLC-DAD analysis. Optimized parameters were as follows; sorbent amount of 5.0 mg for 5.0 mL of 1.0 mg/L vitamin D3 in 90:10 (v/v) ratio of H2O:MeOH solution, 5 hours sorption time and MeOH:HOAc ratio of 90:10 (v/v) as desorption solution. The accuracy of the method was verified with spike recovery test for PBS:MeOH in a ratio of 90:10 (v/v) and overall recovery was found as 85.1 (±4.3, n=3). In latter case, a quartz crystal microbalance (QCM) method was proposed for determination of vitamin D3. Electrochemical polymerization of poly(4-vinylpyridine) MIP/NIP films were achieved on gold working electrode by cyclic voltammetry (CV). Mass-transfer ability of the polymer films were analyzed by electrochemical impedance spectroscopy (EIS). The electrochemical QCM (eQCM) was used to develop thin polymer films on quartz crystals and vitamin D3 determination was achieved by QCM. In a preliminary test, as small a concentration as 0.0100 mg/L vitamin D was detected with the QCM method.Doctoral Thesis Conservation proposals for Göbekli Tepe enclosures(Izmir Institute of Technology, 2022) Çelik, Keziban; İpekoğlu, BaşakThe conservation of archaeological sites is of great importance as they provide physical remains of past civilizations. Göbekli Tepe, which is one of the most important archaeological site in human history was included in the World Heritage List in 2018. Remains in Göbekli Tepe archaeological site are enclosures surrounded by circular or rectangular wall rows, and containing monolithic T-shaped pillars in the center and peripheral walls in two layers. The aim of this study is to examine the construction technique and relations between structural elements and to define conservation problems in order to develop conservation proposals. The method of the study is the evaluation of the data collected during the field survey together with the information given in the literature. In order to determine the similarities and differences between the layers, components and alignment characteristics of enclosures were defined, the relations between these components were examined. It was found that there is relationship between the diameter of enclosure and height of central pillar, and this ratio was same in two enclosures and close in another enclosure. The state of conservation and preservation conditions of the structural elements of the enclosures were examined and risk classes were determined. The problems observed in the structural elements were determined as crack, deformation, fracture, material loss, disintegration. It had been suggested to stabilize the walls to prevent further damage, to design and develop the support system for the pillars, and to carry out regular monitoring to detect possible damage or problems for components.Doctoral Thesis Production and Characterization of Porous Ceramics for High Temperature Applications(Izmir Institute of Technology, 2022) Semerci, Tuğçe; Ahmetoğlu, Çekdar Vakıf; Akdoğan, YaşarThis thesis focuses on the production and characterization of different porous polymer derived ceramic (PDC) components (foams, additively manufactured (AM) honeycombs, and aerogels) and demonstrates their potential for high temperature applications, including gas permeability (up to ~700 o C), molten metal filtration, and heat exchanger. The foams were produced via the replica technique and different pore sizes, ranging from 300 μm to 2 mm, silicon oxycarbide (SiOC) ceramic foams were able to be formed. The average total porosity of the foams was 96 vol% with a specific surface area (SSA) of ~80 m2 /g. AM-made honeycomb-like cellular structures with different cell sizes (578 μm, 1040 μm) were obtained via fused filament fabrication. Finally, SiOC aerogels were synthesized using siloxane resin, then dried at ambient pressure and room temperature. The produced SiOC aerogels showed a total porosity of around 80 vol% and an SSA reaching 250 m2 /g. Regarding the high temperature applications of porous PDC components, initially, the gas permeability of SiOC foams was tested, and the results showed stability up to 700 °C in the air without any loss of functionality, offering reusability even in aggressive environments. In the subsequent studies, filtration of molten aluminum alloy was tested using various porous components. PDC foams demonstrated better performance in comparison to the AM-made cellular structures and commercial SiC foams. Finally, heat exchange analysis was performed to evaluate the heat transfer of SiOC foams, and an increase in pressure drop was found to be directly proportional to the rate of increase in air velocity.Doctoral Thesis Structural Engineering of Halide Perovskites and Their Association With Organics for Optoelectronic Applications(Izmir Institute of Technology, 2022) Yüce Çakır, Hürriyet; Demir, Mustafa Muammer; Yüksel Aldoğan, KıvılcımHalide perovskites show great potential for next-generation optoelectronic applications due to their unique photophysical properties with low production costs. However, their stability issues still prevent their commercialization on a large scale. The main objective of this dissertation is to understand the additive engineering strategy to improve the quality of halide perovskite films and nanocrystals for solar cells and lightemitting diodes. There are two sections to this dissertation: The first section focuses on halide perovskite films and solar cells while the second one focuses on halide perovskite nanocrystals and white light-emitting diodes. In the first section of this dissertation, in Chapter 2-3, the improvement of Sn-Pb and methylammonium-free Pb-based halide perovskite films by additives are investigated. The suppression of defects via additives is demonstrated through structural, elemental, and optical analyses. The improved performance of perovskite solar cells by decreasing defects is also shown. In Chapter 4-5, the change in stability and optical properties of the halide perovskite nanocrystals by means of additive engineering and their applications in white light-emitting diode are studied. The results in this dissertation represent a new approach to improving the structural and photophysical properties of halide perovskites and introduce a new perspective of additive engineering method in the field of halide perovskite-based optoelectronic applications.Doctoral Thesis Exactly Solvable Quantum Parametric Oscillators in Higher Dimensions(Izmir Institute of Technology, 2022) Çayiç, Zehra; Atılgan Büyükaşık, ŞirinThe purpose of this thesis is to study the dynamics of the generalized quantum parametric oscillators in one and higher dimensions and present exactly solvable models. First, time-evolution of the nonclassical states for a one-dimensional quantum parametric oscillator corresponding to the most general quadratic Hamiltonian is found explicitly, and the squeezing properties of the wave packets are analyzed. Then, initial boundary value problems for the generalized quantum parametric oscillator with Dirichlet and Robin boundary conditions imposed at a moving boundary are introduced. Solutions corresponding to different types of initial data and homogeneous boundary conditions are found to examine the influence of the moving boundaries. Besides, an N-dimensional generalized quantum harmonic oscillator with time-dependent parameters is considered and its solution is obtained by using the evolution operator method. Exactly solvable quantum models are introduced and for each model, the squeezing and displacement properties of the time-evolved coherent states are studied. Finally, time-dependent Schrödinger equation describing a generalized two-dimensional quantum coupled parametric oscillator in the presence of time-variable external fields is solved using the evolution operator method. The propagator and time-evolution of eigenstates and coherent states are derived explicitly in terms of solutions to the corresponding system of coupled classical equations of motion. In addition, a Cauchy-Euler type quantum oscillator with increasing mass and decreasing frequency in time-dependent magnetic and electric fields is introduced. Based on the explicit results, squeezing properties of the wave packets and their trajectories in the two-dimensional configuration space are discussed according to the influence of the time-variable parameters and external fields.