Molecular Biology and Genetics / Moleküler Biyoloji ve Genetik
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/9
Browse
2 results
Search Results
Research Project Doksorubisin İlaç Dirençlilik Mekanizmalarının Genomik Yöntemlerle Tespit Edilmesi(2015) Koç, Ahmet; Demir, Ayşe BanuDoksorubisin, çeşitli kanser türlerinin tedavisinde kullanılan en etkili anti-kanser ajanlarından biridir fakat ilacın etkisi, ilaç dirençliliği mekanizmalarından ve ilacın sitotoksisitesinden etkilenmektedir. Bu çalışmada, doksorubisin dirençliliğinde rol oynayan genlerin tespiti amaçlı, yüksek-kopya genomik kütüphane tarama analizleri gerçekleştirilmiş ve dirençlilikte rol oynayan bazı genler (CUE5, AKL1, CAN1, YHR177W ve PDR5) bulunmuştur. Bu genler arasında, PDR5 in aşırı ekspresyonu en güçlü dirençlilik fenotipini göstermiş ve aynı genin delesyonu ise ilaca karşı tolerans seviyesini düşürmüştür. Q-PCR analizleri, bu genlerin transkripsiyonel regulasyonlarının doxorubicin muamelesiyle artmadığını göstermiştir. Bunun üzerine maya hücrelerinin doksorubisin muamelesine bağlı global gen ekspresyon profilleri incelenmiş ve doksorubisin toleransında/toksisitesinde rol oynayan gen ve yolaklar belirlenmiştir. Sonuçlarımız, birçok dışa-atım pompası ve DNA metabolizma genlerinin aktive olduğunu ve doksorubisin toleransı için gerekli olduğunu göstermiştir.Article Citation - Scopus: 21Linking Peroxiredoxin and Vacuolar-Atpase Functions in Calorie Restriction-Mediated Life Span Extension(Hindawi Publishing Corporation, 2014) Molin, Mikael; Demir, Ayşe BanuCalorie restriction (CR) is an intervention extending the life spans of many organisms. The mechanisms underlying CR-dependent retardation of aging are still poorly understood. Despite mechanisms involving conserved nutrient signaling pathways proposed, few target processes that can account for CR-mediated longevity have so far been identified. Recently, both peroxiredoxins and vacuolar-ATPases were reported to control CR-mediated retardation of aging downstream of conserved nutrient signaling pathways. In this review, we focus on peroxiredoxin-mediated stress-defence and vacuolar-ATPase regulated acidification and pinpoint common denominators between the two mechanisms proposed for how CR extends life span. Both the activities of peroxiredoxins and vacuolar-ATPases are stimulated upon CR through reduced activities in conserved nutrient signaling pathways and both seem to stimulate cellular resistance to peroxide-stress. However, whereas vacuolar-ATPases have recently been suggested to control both Ras-cAMP-PKA- and TORC1-mediated nutrient signaling, neither the physiological benefits of a proposed role for peroxiredoxins in H 2O2-signaling nor downstream targets regulated are known. Both peroxiredoxins and vacuolar-ATPases do, however, impinge on mitochondrial iron-metabolism and further characterization of their impact on iron homeostasis and peroxide-resistance might therefore increase our understanding of the beneficial effects of CR on aging and age-related diseases. © 2014 Mikael Molin and Ayse Banu Demir.