Molecular Biology and Genetics / Moleküler Biyoloji ve Genetik
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/9
Browse
2 results
Search Results
Research Project Solanaceae'de kıyaslamalı genom analizleri: model sistem olarak patlıcan (Solanum melongena L.)(2010) Doğanlar, Sami; Mutlu, Sevgi; Frary, Anne; Eanes, Ritchie C.; Daunay, Marie ChristineKıyaslamalı genom analizleri aynı ailenin değişik türleri arasındaki gen ve genomların yapısını ve fonksiyonlarındaki benzerlikleri ve farklılıkları incelemektedir. Esas olarak kıyaslamalı genomiks (1) her türdeki her bir genin rolünü, (2) bir türü diğer bir türden (örneğin fenotipik, büyüme şekli ve çevreye adaptasyon gibi) ayırmadaki önemli değişikliklerin ne olduğunu ve (3) bu değişikliklerin nasıl oluştuğunu (evrimsel işlemleri) araştırmaktadır. Son yirmi yıllık süre içerinde değişik bitki taxa’larında yapılan kıyaslamalı genom analizleri sonucunda, 130-240 milyon yıl süren angiospem evrimi sonrası ortaya çıkan morfolojik, gelişim ve biyokimyasal seviyelerdeki son derece dramatik değişikliklere rağmen, çok değişik bitki türlerinin gen içerikleri ve kromozom boyunca gen sıralarının korunduğu ortaya konmuştur. Dolayısıyla, heterologous DNA markörlerinin ve hatta sekanz bilgilerinin akraba türler arasında kullanımı mümkündür. Türler arasındaki genom bilgilerinin birbirine çevirebilme yeteneği minor öneme sahip çok sayıda diğer bitki türlerinde de genom analizlerini hızlandırmıştır.Article Citation - WoS: 23Citation - Scopus: 26Development of Practical Hplc Methods for the Separation and Determination of Eggplant Steroidal Glycoalkaloids and Their Aglycones(Taylor and Francis Ltd., 2008) Eanes, Ritchie C.; Tek, Neslihan; Kırsoy, Öyküm; Frary, Anne; Doğanlar, Sami; Almeida, Adelia E.A practical set of HPLC methods was developed for the separation and determination of the eggplant steroidal glycoalkaloids, solanine, chaconine, solasonine, solamargine, and their aglycones, solasodine and solanidine. A gradient method was initially developed, but proved to be neither robust nor practical. Three separate isocratic methods using acetonitrile and ammonium dihydrogen phosphate were developed and shown to be more repeatable, less subject to fluctuations in mobile phase composition, and less time consuming. The effect of adjusting buffer pH, column temperature, and buffer type (triethylammonium phosphate vs. ammonium dihydrogen phosphate) were evaluated. It was also discovered that, by addition of 10% methanol to the acetonitrile portion of the mobile phase, more control over the separations was possible. The use of methanol as a mobile phase entrainer greatly improved separations in some cases and its effectiveness was also dependent upon column temperature. Assessments of the method recovery, limit of detection, and limit of quantitation were made using extracts from S. melongena and S. linnaeanum.