Molecular Biology and Genetics / Moleküler Biyoloji ve Genetik
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/9
Browse
3 results
Search Results
Research Project Ulusal Kavun (cucumis Melo) Kolleksiyonlardaki Genetik Çeşitliliğin Belirlenmesi(2009) Frary, Anne; Doğanlar, Sami; Taşkın, Tuncer; Tan, Ayfer; İnal, Abdullah; Mutlu, SevgiTürkiye kavun, hıyar, kabak ve karpuz gibi ürünleri içeren Kabakgiller ailesi için ikinci dereceden genetik çeşitlilik merkezidir. Bu türler için bir mikro çeşitlilik merkezi olarak önemli olmasına ilaveten Türkiye bu ürünlerin dünyadaki en büyük üreticilerinden biri durumundadır ve dünya kavun üretiminde ikinci sırada yer almaktadır. ETAE Ulusal Gen Bankası kolleksiyonları ülke boyunca 48 değişik lokasyondan toplanmış 350 civarında kavun tohum örnekleri (accessions) içermektedir. Bu kolleksiyonlar Türkiye’nin biyoçeşitliliğinin ve değerli genetik kaynaklarının korunmasını ve muhaza edilmesini sağlamaktadır. Bununla birlikte, germplazm idaresi (tohum örneklerinin çoğaltılması, yeniden üretilmesi ve muhafaza edilmesi), özellikle kavun gibi yüksek oranda yabancı döllenme gösteren ve sarılgan bir büyüme şekline sahip olan ürünler için pahalıdır ve çok zaman ve yoğun işgücü gerektirmektedir. Son zamanlarda, çok sayıda araştırma moleküler markörlerin tek başlarına yada morfolojik karakterlerle birlikte germplazm karakterizasyonu ve idaresi için kullanılabilirlikleri üzerine yoğunlaşmıştır. Bu markörlerden elde edilen veriler kolleksiyonlar içerisindeki genetik çeşitliliğin ve tohum örnekleri arasındaki genetik ilişkilerin belirlenmesinde kullanılabilmektedir. Bu bilgiler sinonim yapıdaki (farklı isim altında özdeş genetik yapılar) çeşitlerin elimine edilmesine ve hononim yapıdaki (aynı isim altında farklı genetik yapılar) çeşitlerinde birbirinden ayırt edilmesine olanak sağlayacaktır. Bu şekilde, özgün materyaller çekirdek kolleksiyonlar için belirlenebilmektedir.Article Citation - WoS: 6Citation - Scopus: 8Molecular Genetic Diversity in the Turkish National Melon Collection and Selection of a Preliminary Core Set(American Society for Horticultural Science, 2013) Frary, Anne; Şığva, Hasan Özgür; Tan, Ayfer; Taşkın, Tuncer; İnal, Abdullah; Mutlu, Sevgi; Haytaoğlu, Mehmet; Doğanlar, SamiTurkey is a secondary center of diversity for melon (Cucumis melo) and is home to a variety of regional morphotypes. This diversity is housed in a national germplasm repository with more than 500 accessions. Molecular genetic variability of 209 melon genotypes from 115 accessions of this collection was characterized using amplified fragment length polymorphisms (AFLPs). Ten AFLP primer combinations yielded 279 reproducible fragments, which were used for dendrogram and principal coordinate analyses. These analyses showed two major clusters of Turkish melons: one group contained highly similar genotypes (maximum Dice dissimilarity coefficient of 0.18), whereas the other group was genetically more diverse (maximum dissimilarity 0.41). Although average dissimilarity was low (0.13), a broad range of genetic diversity was observed in the collection. A marker allele richness strategy was used to select a core set of 20 genotypes representing the allelic diversity of the AFLP data. The core set had double the average diversity (0.26) of the entire set and represented the major morphotypes present in the collection. Molecular genetic diversity of the core set was further validated using simple sequence repeat marker data (116 polymorphic fragments), which confirmed that the selected core set retained high levels of molecular genetic diversity.Article Citation - WoS: 7Citation - Scopus: 6Water-Soluble Antioxidant Potential of Melon Lines Grown in Turkey(Taylor and Francis Ltd., 2012) Şelale, Hatice; Şığva, Hasan Özgür; Çelik, İbrahim; Doğanlar, Sami; Frary, AnneThe antioxidant potential of 42 melon (Cucumis melo) lines including six cultivars grown in Turkey was assessed by measuring total water-soluble antioxidant capacity, phenolic and vitamin C contents. The lines showed significant variability for all three antioxidant parameters with breeding lines having higher antioxidant capacity and phenolic content than some popular cultivars. Different types of melons also showed significantly different antioxidant potentials. Thus, galia and ananas types showed a higher mean antioxidant capacity and phenolic content than the other tested types (yuva, kislik, canary, and charentais). Correlation analysis between antioxidant parameters showed a significant correlation between water-soluble antioxidant capacity and phenolic content. © 2012 Copyright Taylor and Francis Group, LLC.