Molecular Biology and Genetics / Moleküler Biyoloji ve Genetik
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/9
Browse
2 results
Search Results
Research Project Afrika yeşil maymunu CV-1 hücre hatlarında, HIV-1 tat proteini varlığında üretilen SLPI proteininin insan hücre hatlarındaki üretiminin incelenmesi ve HIV-1 LTR promotoruna etkisinin araştırılması(2017) Arslanoğlu, Alper; Koç, Ahmet; Karakaya, Hüseyin ÇağlarProjemiz, HIV-1 enfeksiyonuna dirençli oldukları bilinen Afrika Yeşil Maymunu hücrelerinde daha önce varlığı tespit edilmemiş HIV-1 engelleyici protein veya proteinlerin varlığını araştırmayı amaçlamıştır. Söz konusu proteinlerin hücre içi bağışıklık mekanizmaları tarafından virüs varlığının algılanmasından sonra üretilmesi ihtimali göz önüne alındığında, HIV-1 ile enfekte olan hücrelerde ilk üretilen iki viral proteinden birisi olan Tat proteininin varlığı virüs enfeksiyonunun belirteci olabileceği düşünülmüştür. Bu bağlamda, iki boyutlu poliakrilamid jel elektroforezi ve kütle spektrometrisi kullanılarak yapılan proteomik ön çalışmalarımız, ardından da proje kapsamında yaptığımız Western blot ve gerçek zamanlı PZR çalışmaları neticesinde, maymun hücrelerinde SLPI proteininin HIV-1 Tat varlığında arttığı, ancak insan hücrelerinde herhangi bir değişiklik olmadığı gözlenmiştir. SLPI proteininin, Reporter gen kullanımıyla yapılan trankripsiyon transaktivasyon analizleri neticesinde HIV-1 promotoru üzerine baskılayıcı etkisi olduğu anlaşılmış, enfeksiyon deneylerinde de HIV-1 üretimini belirgin olarak azalttığı gösterilmiştir.Article Citation - WoS: 27Citation - Scopus: 36Purification and Biochemical Characterization of an Extracellular Lipase From Psychrotolerant Pseudomonas Fluorescens Ke38(TUBITAK, 2013) Adan Gökbulut, Aysun; Arslanoğlu, AlperAn extracellular lipase producing bacterium was isolated from a soil sample, and identified as a strain of Pseudomonas fluorescens by 16S rRNA gene sequencing. It was named Pseudomonas fluorescens KE38. KE38 showed psychrotolerant properties with an optimum growth temperature of 25 °C. The lipase enzyme secreted by KE38 was purified 41.13-fold with an overall yield of 54.99%, and a specific activity of 337.3 U/mg. The molecular mass of purified lipase was estimated to be approximately 43 kDa by SDS-PAGE. Although the lipase was active at a temperature range of 15-65 °C, it exhibited maximum activity at 45 °C, at pH 8.0. The enzyme exhibited high stability retaining 100% and 70% of its activity after an incubation period of 45 and 100 min at 45 °C and pH 8.0 respectively. It also showed a broad substrate specificity acting on p-nitrophenyl esters with C8-C18 acyl groups as substrates and was activated by Ca2+ and Ni2+ at 1 mM. While the enzyme retained its activity levels in the presence of a variety of organic solvents, DMSO and dimethylformamide enhanced this. High stability, broad substrate specificity and activity at cold temperatures in the presence of organic solvents, and metal ions make the extracellular lipase of KE38 a candidate for industrial applications.