Büyükkileci, Ali Oğuz
Loading...
Profile URL
Name Variants
Buyukkileci, A. O.
Buyukkileci, Ali Oguz
Büyükkileci, Ali O.
Buyukkileci, Ali O.
Büyükkileci, A. O.
Buyukkileci, Ali Oguz
Büyükkileci, Ali O.
Buyukkileci, Ali O.
Büyükkileci, A. O.
Job Title
Email Address
oguzbuyukkileci@iyte.edu.tr
Main Affiliation
03.08. Department of Food Engineering
Status
Current Staff
ORCID ID
Scopus Author ID
Turkish CoHE Profile ID
Google Scholar ID
WoS Researcher ID
Sustainable Development Goals
1NO POVERTY
0
Research Products
2ZERO HUNGER
14
Research Products
3GOOD HEALTH AND WELL-BEING
5
Research Products
4QUALITY EDUCATION
2
Research Products
5GENDER EQUALITY
1
Research Products
6CLEAN WATER AND SANITATION
14
Research Products
7AFFORDABLE AND CLEAN ENERGY
13
Research Products
8DECENT WORK AND ECONOMIC GROWTH
9
Research Products
9INDUSTRY, INNOVATION AND INFRASTRUCTURE
18
Research Products
10REDUCED INEQUALITIES
0
Research Products
11SUSTAINABLE CITIES AND COMMUNITIES
3
Research Products
12RESPONSIBLE CONSUMPTION AND PRODUCTION
11
Research Products
13CLIMATE ACTION
14
Research Products
14LIFE BELOW WATER
5
Research Products
15LIFE ON LAND
4
Research Products
16PEACE, JUSTICE AND STRONG INSTITUTIONS
0
Research Products
17PARTNERSHIPS FOR THE GOALS
1
Research Products
Documents
20
Citations
493
h-index
11
Documents
25
Citations
440
Scholarly Output
51
Articles
22
Views / Downloads
32819/19566
Supervised MSc Theses
18
Supervised PhD Theses
5
WoS Citation Count
432
Scopus Citation Count
478
Patents
0
Projects
13
WoS Citations per Publication
8.47
Scopus Citations per Publication
9.37
Open Access Source
33
Supervised Theses
23
| Journal | Count |
|---|---|
| New Biotechnology | 3 |
| GIDA | 3 |
| Industrial Crops and Products | 3 |
| Carbohydrate Polymers | 2 |
| Biomass Conversion and Biorefinery | 2 |
Current Page: 1 / 4
Scopus Quartile Distribution
Competency Cloud
51 results
Scholarly Output Search Results
Now showing 1 - 10 of 51
Doctoral Thesis Physiologic Effects of the Golden Thistle (scolymus Hispanicus L.) Hydromethanolic Extracts: Outcomes of Phytochemical Health Benefits(01. Izmir Institute of Technology, 2022) Özel Taşcı, Cansu; Güleç, Şükrü; Büyükkileci, Ali Oğuz; Güleç, Şükrü; Büyükkileci, Ali OğuzThis dissertation aimed to screen the beneficial health effects of a hydromethanolic extract (GTE) obtained from the golden thistle (S. hispanicus L.) on different health conditions, including type 2 diabetes, inflammation, cancer, and wound healing. First, 1 mg/mL GTE resulted in 6.94% chlorogenic acid (CGA) bioavailability with (1.82±0.07)x10-6 cm/s apparent permeability on differentiated CaCo-2 cells. Then, 1 mg/mL GTE prompted 39.4-42.6% less glucose efflux and 49-66% less GLUT2 mRNA expressions on CaCo-2 cells. In the systemic inflammation model, pre-treatments of 50-500 μg/mL GTE reduced some inflammatory markers after 0.5 μg/mL lipopolysaccharide (LPS) inflammation induction for 12 h on RAW 264.7 cells. Reductions in 30-53%, 32-45% and 16-36% ranges for nitric oxide, tumor necrosis factor-α, and interleukin-6 (IL-6) were determined, respectively. Additionally, same GTE concentrations were pre-treated with the CaCo-2 cells in the colonic inflammation model. 15.5-19.5% and 8.7-17.3% less IL-6 and IL-8 cytokine releases were detected from CaCo-2 cells, respectively. The wound healing model of 3T3-L1 mouse fibroblasts revealed that 40-80 μg/mL root bark extract resulted in enhanced wound closures with significant differences in the cell cycle distributions. As the most significant result, G2 phase distributions were 1.8% and 12.5% in the negative and positive control samples, respectively. The root bark extract treatments of 10, 40, and 80 μg/mL resulted in 6.6%, 7.1%, and 9.1% in increasing concentrations. Finally, 4 mg/mL GTE application to CaCo-2 human adenocarcinoma cells caused 78.4% reduced cell viability, a cell cycle arrest, and increased early and late apoptotic properties. Overall results suggest that S. hispanicus L. has functional molecules that influence cellular regulations and have potential beneficial health effects.Article Citation - WoS: 14Citation - Scopus: 12Enhanced Production of Exo-Polygalacturonase From Agro-Based Products by Aspergillus Sojae(North Carolina University, 2011) Büyükkileci, Ali Oğuz; Tarı, Canan; Fernandez-Lahore, MarcelloAspergillus sojae has been previously shown to produce exo-polygalacturonase (exo-PG) in synthetic media, where the potential of the organism to utilize agricultural substrates was not considered so far. In this study, the utilization of agro-based products was taken into account in the enhanced production of exo-PG using an A. sojae mutant by applying statistical design methods. Complex sources (orange peel, wheat bran, and corn meal), simple sugar sources (glucose, maltrin, and sugar beet syrup), and two phosphate salts were screened using D-optimal design method. Orange peel yielded the highest exo-PG activity with all simple sugars and phosphate sources. According to the results of response surface methodology (RSM), the optimum concentrations of orange peel, sugar beet syrup, and (NH 4) 2SO 4 were found to be 10, 60, and 8 g L -1, respectively. The exo-PG activity under these conditions was 145.4 U m L -1 in shake flask cultures. In bioreactor studies enzyme production was induced at low pH values; thus highest production was obtained under uncontrolled pH conditions, in which the pH dropped to 2.0 in 72 h. As a result high exo-PG could be produced by an A. sojae mutant using a cost-effective medium containing agro-industrial substrates. Another important advantageous outcome was the low optimal pH, which is especially desired in industrial fermentations prone to contamination problems. In fact this highlights the easy adaptation of this fermentation to industrial scales.Master Thesis Bacterial Cellulose Production With Gluconoacetobacter Xylinus From Hazelnut Waste(01. Izmir Institute of Technology, 2024) Gazioğlu, Metehan; Frary, Anne; Büyükkileci, Ali OğuzBakteriyel selüloz (BC), biyomedikal, kozmetik ve elektronik gibi birçok endüstriyel alanda önemli potansiyele sahip doğal bir biyopolimerdir. BC'nin özellikleri arasında yüksek yüzey alanı, sıvı ve gaz geçirgenliği, biyobozunabilirlik ve modifiye edilebilirlik bulunur. Bu çalışmada bakteriyel selüloz üretimi gluconacetobacter xylinus tarafından gerçekleştirilmiştir. BC üretimini optimize etmek için çeşitli çevresel koşullar ve besiyerleri test edilmiştir. Bu çalışmada, fındık kabuklarının asit ve baz kimyasal ön işlemleri ile elde edilen şekerlerin kullanımına odaklanılmıştır. Fındık kabuğunun kimyasal içeriği belirlenmiş ve lignin, selüloz ve hemiselüloz oranları sırasıyla %42,09, %21,84 ve %22,99 olarak bulunmuştur. Bu içerikler, farklı ön işlem yöntemlerinin etkinliğini değer- lendirmek için kullanılmıştır. Fındık kabukları, farklı kimyasallar ile ön işlem- den geçirilmiş ve şeker salınımı açısından değerlendirilmiştir. Alkali ön işlemler, şeker salınımı açısından daha etkili bulunmuştur. Özellikle, %1'lik potasyum hidroksit ve %3'lük sodyum hidroksit ile ön işlem gören numuneler sırasıyla 37,8 ve 39 g/L en yüksek şeker konsantrasyonuna sahip olmuştur. Optimiza-syon çalışmaları kapsamında inokülasyon oranı, pH değeri, gün ve etanol varlığı gibi parametreler incelenmiştir. %10 inokülasyon oranı, 10 gün ve pH 6 ile en yüksek BC verimi elde edilmiştir. Kıyaslanan kültürlere bakıldığında %1 potasyum hidroksit ile ön işlem görmüş sonrasında da besiyeri içerisinde %1'lik etanol bulunan besiyerinde 2369 mg/L' de en çok bakteriyel selüloz üretildiği belirlenmiştir. Farklı kültürlerden alınan bakteriyel selülozlarda etanol ilavesinin su tutma kapasitesini azalttığ görülmüştür. FT-IR sonuçları bütün örneklerin saf olarak elde edildiğini ve yapısal bütünlüğün korunduğu göstermiştir. Bu tez, BC üretimini optimize etmek için gerekli olan koşulları belirlemekte ve fındık kabuklarının sürdürülebilir bir şeker kaynağı olarak kullanılabileceğini göstermektedir.Article Citation - WoS: 6Citation - Scopus: 7Designing Robust Xylan/Chitosan Composite Shells Around Drug-Loaded Msns: Stability in Upper Git and Degradation in the Colon Microbiota(Elsevier, 2023) Zeybek, Nüket; Büyükkileci, Ali Oğuz; Güleç, Şükrü; Polat, Mehmet; Polat, Hürriyetong residence times, near-neutral pH values, and release triggered by the enzymatic action of the resident microbiota offer unique opportunities for improved drug delivery in the colon. The fact that a delivery agent must also pass through the complete GI tract without degradation presents a challenge due to widely changing pH conditions. In this study, a promising colon-targeted drug delivery system was composed of a xylan/chitosan composite shell formed on curcumin-loaded mesoporous silica nanoparticles (MSNs). A novel synthesis approach was employed to facilitate precipitation of negatively charged xylan on negatively charged MSNs by concurrent chitosan polymerization. Curcumin-loaded xylan/chitosan-coated MSNs (C-MSNs) were determined to contain nearly 42% xylan by the inclusion of chitosan in a one-to-one ratio with xylan. The xylan/chitosan composite shell demonstrated excellent stability in the acidic upper GI tract. The hydrolysis of glycosidic bonds by resident microbiota was the triggering mechanism for xylan degradation and curcumin release in the colon. The presence of xylan has the further benefit of increasing the number of beneficial bacteria and improving short-chain fatty acid production for improved colon health.Master Thesis Population Genomics of Crohn Disease Susceptibility(01. Izmir Institute of Technology, 2024) Narli, Bengisu; Sezgin, Efe; Büyükkileci, Ali OğuzCrohn Hastalığı (CD), gastrointestinal sistemin kronik inflamasyonuna neden olan inflamatuar bir bağırsak hastalığıdır. Modern popülasyonlarda CD'ye yatkınlığı artıran genetik yapının, enfeksiyonlara ve patojenlere direnç gibi belirli çevresel stres faktörlerine karşı seçici avantaj sağlayan türetilmiş bir özellik olduğu iddia edilmektedir. Bu nedenle, CD ile ilişkili genlerde seçilim belirtileri olmalıdır. CD riskinin türetilmiş seçilmiş bir özellik olup olmadığını test etmek için, literatür taramaları yoluyla CD ile ilişkili genler ve varyantlar belirlenmiştir. Allen veriseti ve 1000 Genom Projesi aracılığıyla eski ve modern nüfus verileri toplanmıştır. Veriler Plink ve R kullanılarak analiz edilmiştir. 352 CD risk aleli tanımlanmıştır ve CD ile ilişkili alellerin hastalık risk durumu (koruyucu ve duyarlı) atasal ve türetilmiş durumlarıyla karşılaştırılmıştır. Dünya çapındaki dört metapopülasyonun bu alellere göre farklılaşması incelenmiştir. Ayrıca, eski ve modern popülasyonlar arasındaki alel frekansı farklılıkları karşılaştırılmıştır. Günümüz metapopülasyonları arasındaki genetik farklılaşma ve ayrımın, CD ile ilişkili PUS10 ve PPBP_CXCL5 genlerinin etkisine bağlı olduğu, antik ve modern metapopülasyonlardaki ayrımın ise PPP5C, PPBP_CXCL5 ve AIMP1P2 genlerinin etkisi olduğu gözlemlenmiştir. CD prevalansının daha yüksek olduğu popülasyonlarda daha yüksek risk alel frekanslarına sahip olduğu belirlenmiştir. CD ile ilişkili IRGM, OR2B11 ve IL10 genlerindeki varyantlar, atasal ve modern Avrupa popülasyonları karşılaştırıldığında zaman içinde yüksek alel frekansı değişiklikleri göstermiştir. Gen bazlı son seleksiyon analizleri, CD ile ilişkili HERC2, MACROD2, RBFOX1, ITLN1 ve RNFT1P2 genlerinde etkili olan olası pozitif seçilime işaret etmiştir.Article Kritik Altı Su ile Fındık Atıklarından Antioksidan Bileşiklerin Ekstraksiyonu(Gıda Teknolojisi Derneği, 2018) Sürek, Ece; Büyükkileci, Ali OğuzTürkiye fındık üretim ve ihracatında dünya lideridir. Fındığın tarımı ve işlenmesi sırasında büyük miktarda kabuk, zuruf ve dal gibi atıklar açığa çıkmaktadır. Bu atıkların çevre dostu bir teknoloji ile işlenmesi ve önemli ürünlerin üretilmesi katma değer sağlayabilir. Bu çalışmada, fındık atıklarının farklı sıcaklık (150-200?C) ve sürelerde (0-45 dk) kritik altı su ekstraksiyonu ile elde edilen likörlerinin toplam fenolik madde içeriği (TFİ) ve toplam antioksidan aktiviteleri (TAA) incelenmiştir. Genel olarak, kritik altı su ekstraksiyonu ile aseton ve metanol ekstraksiyonuna göre daha yüksek verim elde edilmiştir. Sıcaklık arttıkça fındık kabuğundan elde edilen TFİ ve TAA artmıştır. Süre artışı 180?C'de istatistiksel olarak önemli bir fark yaratmazken, 190?C'de TFİ süre arttıkça yükselmiştir (P <0.05). Bu iki koşulun fındık kabuğu üzerine etkisi şiddet faktörünün logaritmik değeri (log Ro) hesaplanarak tek bir parametrede de incelenmiştir. log Ro arttıkça TFİ (905.3-2115.7 mg GAE/100 g kabuk) ve TAA (8163.9-12261.5 mg TE/100 g kabuk) değerleri yükselmiştirArticle Citation - WoS: 1Citation - Scopus: 1Temperature and Glycerol Formation: a Proposal To Explain the Causal Relationship Based on Glycolytic Enzyme Activities(American Society for Enology and Viticulture, 2019) Büyükkileci, Ceylan; Batur, Ayşem; Büyükkileci, Ali Oğuz; Hamamcı, HalukMost yeast strains produce glycerol in larger quantities when cultivated at higher temperatures, which likely explains why red wines contain higher amounts of glycerol than white wines. In this work, we used a kinetic and thermodynamic approach to suggest a mechanistic explanation for this phenomenon. We began with a glycolytic model of the kinetics of the individual enzymes. The effects of temperature and ethanol on the apparent kinetics of individual enzymes were then determined and incorporated into the model. The activation energy for each enzyme was determined with the Arrhenius equation. The enzymes in the upper part of the glycolytic pathway were found to be more dependent on the temperature than those in the lower part. The model, as improved by these changes, could qualitatively simulate the ethanol and glycerol production curves and the production of more glycerol at higher temperatures. We propose that the differences in the temperature dependence of the enzymes around the glycerol branch are the reason for glycerol accumulation at higher temperatures.Conference Object Citation - WoS: 1Contributions To Modelling of Glycolytic Pathway of Saccharomyces Cerevisiae(Elsevier Ltd., 2012) Büyükkileci, Ceylan; Büyükkileci, Ali Oğuz; Hamamcı, Haluk[No abstract available]Article Utilization of White Grape Pomace for Lactic Acid Production(Gıda Teknolojisi Derneği, 2018) Bayrak, Emrah; Büyükkileci, Ali OğuzBeyaz üzüm posası (BÜP), biyo-temelli kimyasalların fermantasyonla üretimi için kullanılma potansiyeline sahip yüksek miktarda çözünmüş karbonhidrat (glikoz ve fruktoz) içerir. Bu çalışmada, bu atık Lactobacillus casei ile laktik asit (LA) üretilerek değerlendirilmiştir. BÜP kültür ortamına %10 oranında doğrudan eklendiğinde 33.3 g/L LA elde edilmiştir. BÜP'ün sulu özütü daha hızlı bir LA üretimi sağlamıştır. Özüt çıkarma aşamasında posa miktarının artırılması sayesinde daha fazla LA elde edilmiştir ancak, bu işlem üretim verimini kayda değer biçimde düşürmüştür. Tüm koşullarda fruktoz glikoza göre daha yavaş kullanılmıştır. LA üretimi için 10 g/L maya özütü tozu gerekmiştir. Buna alternatif olarak, ekmek mayası otolize uğratılmış ve bu lizat azot kaynağı olarak başarıyla kullanılmıştır. Bulgulara göre, BÜP'ün L. casei ile LA üretimi için sürdürülebilir bir kaynak olduğu düşünülebilir, ancak, posada bulunan diğer maddelerin olası olumsuz etkileri önlenmelidirMaster Thesis Extraction of Phytochemicals From Scolymus Hispanicus and Determination of Potential Health Effects(Izmir Institute of Technology, 2017) Ahmad, Bilal; Büyükkileci, Ali Oğuz; Güleç, ŞükrüGolden thistle (Scolymus hispanicus) is an edible medicinal plant growing in Turkey. It has been in use since decades for the treatment of various disorders by local folks. In the past the extracts from the root barks of S. hispanicus were in use in the form of a medicine for the removal of kidney stones. Its root barks are the only eaten part and the root internal and aerial parts are considered as residues. The effect of harvesting time and plant maturity on phytochemicals composition of this plant have not been studied before. Besides that, in previous studies only the edible part was analyzed for bioactive constituents and the residues (aerial parts and root internal parts) have not been analyzed before. In this study, various phytochemicals and total antioxidant activities in the ethanol extracts of aerial parts, root barks and root internal tissues of S. hispanicus harvested from November 2016 to July 2017 were measured. The dominant phytochemicals were different in the roots and the aerial parts, whereas phytochemicals were influenced differently by the harvesting time. Total phenol contents and total antioxidant activities were higher in the aerial parts than the root parts, while total triterpenoid contents were higher in root barks and root internal tissues. Thin Layer Chromatography (TLC) analysis showed that there were not any free triterpenoids in the extracts, however there were glycosides, which may have contained triterpenoids. The crude extracts of S. hispanicus showed cytotoxic effects on Caco-2 cells growth. The results suggested that these extracts might have potential preventative effects on colon cancer.