Investigation of the Effect of 4'-alkylıklavuzon Derivatives on Nucleotide Synthesis and Nucleocytoplasmic Transport

dc.contributor.advisor Çağır, Ali
dc.contributor.advisor Köksal, Mustafa
dc.contributor.author Kutluer, Meltem
dc.contributor.author Köksal, Mustafa
dc.contributor.author Çağır, Ali
dc.date.accessioned 2017-02-13T13:05:41Z
dc.date.available 2017-02-13T13:05:41Z
dc.date.issued 2016
dc.description Includes bibliographical references (leaves: 38-45) en_US
dc.description Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Biotechnology, Izmir, 2016 en_US
dc.description Full text release delayed at author's request until 2019.08.17 en_US
dc.description Text in English; Abstract: Turkish and English en_US
dc.description xi, 45 leaves en_US
dc.description.abstract In anti-cancer agent development studies one of the most significant issue is to get an agent that specifically targets cancer cells without any effects on healthy cells. Goniothalamin, that is a styryl lactone isolated from Goniothalamus plant species, is an anti-cancer agent that has selective anti-proliferative activity on cancer cell lines. Klavuzon and derivatives, which can be thought as analogs of goniothalamin, are more cytotoxic in cancer cells compared to goniothalamin. Previous structure activity relationship studies implies that α,β-unsaturated δ-lactone moiety is the source of the biological activity. Since it behaves as Michael acceptor, in this thesis possible irreversible inhibitions of two separate intracellular targets are investigated. In the first part, thymineless death caused by possible thymidylate synthase inhibition has been studied. Anti-proliferative effect of 4’-methylklavuzon in HuH-7 cancer cell line was tested by using MTT. Viability of klavuzon treated cells did not changed significantly in the absence and presence of varying concentration of additional thymidine supplement, and it is concluded that thymineless death is not a crucial mechanism for klavuzon derivatives. In the second part, 4’-methylklavuzon and its derivatives were tested on HeLa cell line to investigate inhibitory effect on the nucleocytoplasmic transport. Immunocytochemistry was used to demonstrate nucleocytoplasmic localization of Riok2 protein which is transferred from nuclei to cytoplasm by CRM1 nuclear export protein. Successfully, all tested klavuzon derivatives inhibit CRM1 nuclear export protein. Potency of the inhibition depends on the size of the alkyl substituent at 4’- position of klavuzon. en_US
dc.description.abstract Antikanser ajan geliştirme çalışmalarda en önemli konulardan birisi spesifik olarak kanserli hücreleri hedef alıp sağlıklı hücrelere zarar vermeyen bir ajanın keşfidir. Goniothalamin, Goniothalamus bitki türlerinden izole edilmiş bir stiril lakton olup, kanserli hücrelerin çoğalmalarına karşı seçici aktivitesi bulunan bir anti-kanser ajandır. Klavuzon ve türevleri bir tür goniothalamin türevi olarak düşünülebilirler ve goniothalamine oranla kanser hücrelerine karşı daha sitotoksiklerdir. Daha önceki yapı-aktivite ilişkisi çalışmalarında α,β-doymamış δ-lakton yapısının biyolojik aktivite için gerekli olduğu bilinmektedir. Bu grup Michael akseptörü olarak görev aldığından bu tez kapsamında iki farklı hücre içi mekanizmanın geridönüşümsüz inhibisyonu araştırılmıştır. Çalışmanın ilk bölümünde, olası bir timidilat sentaz inhibisyonuna bağlı olarak gerçekleşebilecek timidinsiz ölümün varlığı araştırılmıştır. Farklı konsantrasyonlarda timidin varlığında veya yokluğunda klavuzonla muamele edilmiş hücrelerin canlılıklarında herhangi bir değişiklik olmamıştır, bu nedenle timinsiz ölüm olayının klavuzon türevleri için önemli bir mekanizma olmadığı sonucuna varılmıştır. İkinci bölümde ise, 4'-metilklavuzon ve türevlerinin nükleositoplazmik transport üzerindeki etkilerini araştırmak için HeLa hücreleri üzerinde test edilmiştir. CRM1 proteini tarafından taşınan Riok2 proteininin nükleositoplazmik yerini göstermek için immünositokimya kullanılmıştır. Başarılı bir şekilde test edilen tüm klavuzon türevleri CRM1 proteini inhibe etmişlerdir. Maddelerin inhibisyon potansiyeli klavuzonun 4’- konumundaki alkil grubunun büyüklüğüne bağlı olarak değişmektedir. en_US
dc.description.sponsorship TÜBİTAK 2210-C Domestic Priority Areas Graduate Scholarship Programme en_US
dc.identifier.citation Kutluer, M. (2016). Investigation of the effect of 4'-alkylıklavuzon derivatives on nucleotide synthesis and nucleocytoplasmic transport. Unpublished master's thesis, İzmir Institute of Technology, İzmir, Turkey en_US
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/11147/4832
dc.language.iso en en_US
dc.publisher Izmir Institute of Technology en_US
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess en_US
dc.subject Anti-cancer agent en_US
dc.subject Cancer cells en_US
dc.subject Goniothalamin en_US
dc.subject Nucleocytoplasmic transport en_US
dc.subject Moleculer trafficking en_US
dc.title Investigation of the Effect of 4'-alkylıklavuzon Derivatives on Nucleotide Synthesis and Nucleocytoplasmic Transport en_US
dc.title.alternative 4'-alkil Klavuzon Türevlerinin Nükleotid Sentezi ve Nükleositoplazmik Transport Üzerindeki Etkisinin İncelenmesi en_US
dc.type Master Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
gdc.author.institutional Kutluer, Meltem
gdc.coar.access open access
gdc.coar.type text::thesis::master thesis
gdc.description.department Thesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Bioengineering en_US
gdc.description.publicationcategory Tez en_US
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery 2980fbb4-d6f7-4bea-95d4-d33a12037c9d
relation.isOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery 9af2b05f-28ac-4013-8abe-a4dfe192da5e

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Name:
T001501.pdf
Size:
1.87 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
MasterThesis

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: