Expression of Aquaporin 1, 3 and 4 in T Cell Activation and Apoptosis

dc.contributor.advisor Nalbant Aldanmaz, Ayten
dc.contributor.author Gelmez, Ayşe Bengisu
dc.date.accessioned 2018-11-21T07:20:19Z
dc.date.available 2018-11-21T07:20:19Z
dc.date.issued 2018
dc.description Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics, Izmir, 2018 en_US
dc.description Includes bibliographical references (leaves: 39-43) en_US
dc.description Text in English; Abstract: Turkish and English en_US
dc.description.abstract Aquaporins (AQPs) are membrane proteins responsible for transporting water, some gases and small solutes such as CO2 and glycerol. Until now, it has been shown that AQP1, 3 and 5 expressed in both B and T lymphocytes of mice, regulate cell volume. However, aquaporin expression involved in activation, proliferation, and differentiation as well as apoptosis of T cells are not well known yet. The goal of this study is to detect the expression level of AQP1, AQP3, and AQP4 in activated and apoptotic T cells. In order to do that, two types of T cells cultured in both condition were utilized. Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMCs) were isolated from Human peripheral blood drawn from healthy donors by ficoll density gradient Centrifugation method. Naive CD4+ T cells were sorted from PBMC. The stimulants generating Th17 were chosen for activation and differentiation of naïve CD4 T cells. Jurkat cell line as a second cell type were activated by PMA/Ionomycin as well as treated by camptothecin for apoptotic processing. Th17 and Jurkat cell cultures were analysed by flow cytometry to measure the rate of both activation and apoptosis. Western Blot was performed to identify expression of AQP 1, 3 and 4. We found a significance between increased expression level of AQP1, 3, and 4 in activated T cells as well as decreased expression level of each three AQPs in apoptotic T cell populations. According to our findings, tested aquaporin proteins may play roles in T cell activation, differentiation, and apoptosis. The scientific significance of this research is that it can fill the gaps about these three functional processes of T cells. Besides, all findings can contribute to treatment of many autoimmune disease like MS which Th17 cells involve in pathogeny. en_US
dc.description.abstract Aquaporinler suyun, CO2 gibi bazı gazların ve gliserol çözünmüş küçük maddelerin transferinden sorumlu olan hücre zarı proteinleridir. Şu zamana kadar, AQP1, 3 ve 5 proteinlerinin hücre hacmini düzenlemek için B ve T lenfositlerinin ikisinde de ekspresyonun olduğu farelerde gösterilmiştir. Bununla birlikte, bu aquaporinlerin T hücrelerinin aktivasyonundaki, çoğalmasındaki, farklılaşmasındaki ve apoptozdaki katkısı henüz açıklığa kavuşmamıştır. Bu çalışmanın amacı, AQP1, AQP3 ve AQP4 proteinlerinin aktive edilmiş ve apoptotik T hücrelerindeki ekspresyon seviyelerini saptamaktır. Bunu yapabilmek için farktı koşullarda bulunan iki tip T hücresi kullanılmıştır. Sağlıklı donörlerden alınan kanlardan PBMC, ficoll yoğunluk tırmanışında çeperleme yöntemi ile izole edilmiştir. Naif CD4+ T hücreleri bu PBMC’ den ayrılmıştır. Naif CD4+ T hücrelerinin aktivasyonu ve farklılaşması için Th17 oluşturan uyaranlar seçilmiştir. İkinci hücre tipi olarak Jurkat hücre hattı PMA/Ionomycin ile aktive edilmiştir ve apoptotik süreç için camptothecin ile muamele edilmiştir. Aktivasyon ve apoptoz oranlarını ölçmek için Th17 ve Jurkat hücre kültürleri flow sitometride analiz edilmiştir. AQP1, 3 ve 4 proteinlerinin ekspresyonunu belirlemek için western blot yapılmıştır. AQP1, 3 ve 4’ün artan ekspresyon seviyeleri ile aktive edilmiş T hücreler ve azalan ekspresyon seviyeleri ile apoptotik T hücre popülasyonu arasında anlamlılık bulduk. Bulgularımıza göre, test edilen aquaporin proteinleri T hücrelerinin aktivasyonunda, farklılaşmasında ve apoptozunda rolü olabilir. Bu araştırmanın bilimsel önemi, T hücrelerinin aktivasyon ve farklılaşma süreçleri hakkındaki boşlukları doldurabilir olmasıdır. Bunla birlikte bütün bulgular Th17 hücrelerinin de dahil olduğu MS gibi otoimmün hastalıklarının tedavisine katkı sağlayabilir. en_US
dc.description.sponsorship Scientific and Technological Research Council of Turkey (TUBITAK) Project 215Z127 en_US
dc.format.extent ix, 43 leaves
dc.identifier.citation Gelmez, A. B. (2018). Expression of aquaporin 1, 3 and 4 in T cell activation and apoptosis. Unpublished master's thesis, Izmir Institute of Technology, Izmir, Turkey en_US
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/11147/6996
dc.language.iso en en_US
dc.publisher Izmir Institute of Technology en_US
dc.relation info:eu-repo/grantAgreement/TUBITAK/KBAG/215Z127 en_US
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess en_US
dc.subject Aquaporin 1 en_US
dc.subject Aquaporin 3 en_US
dc.subject Aquaporin 4 en_US
dc.subject Apoptosis en_US
dc.subject T cell en_US
dc.title Expression of Aquaporin 1, 3 and 4 in T Cell Activation and Apoptosis en_US
dc.title.alternative Aquaporin 1, 3 ve 4 Proteinlerinin T Hücresi Aktivasyonu ve Apoptozunda Ekspresyonları en_US
dc.type Master Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
gdc.author.institutional Gelmez, Ayşe Bengisu
gdc.coar.access open access
gdc.coar.type text::thesis::master thesis
gdc.description.department Thesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics en_US
gdc.description.publicationcategory Tez en_US
gdc.description.scopusquality N/A
gdc.description.wosquality N/A
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery 125d6076-c66b-4ae3-b026-0ff2df54b3e3
relation.isOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery 9af2b05f-28ac-4013-8abe-a4dfe192da5e

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Name:
T001735.pdf
Size:
2.1 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
MasterThesis

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: