Optimization of a Liver Organ on Chip System for the Investigation of Breast Cancer Cell Invasion

dc.contributor.advisor Yalçın Özuysal, Özden
dc.contributor.author Tosunoğlu, Perge Bilgesu
dc.date.accessioned 2023-11-03T08:25:08Z
dc.date.available 2023-11-03T08:25:08Z
dc.date.issued 2023
dc.description Thesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Molekular Biology and Genetics, Izmir, 2023 en_US
dc.description Includes bibliographical references (leaves. 49-52) en_US
dc.description Text in English; Abstract: Turkish and English en_US
dc.description.abstract There are many challenges in creating an accurate and physiologically relevant three-dimensional (3D) model of the liver such as finding the suitable liver extracellular matrix (ECM) components and cell types for the development of cell-laden liver-on-a-chip systems. In recent years, precision tissue slice-based methods are used to reduce the problems caused by the cell-laden liver-on-a-chip system complexity. However, these methods require sophisticated tools which are not easily accessible. This study focuses on the development of a 3D liver model using simple and cost-effective methods. To achieve this, we aimed to optimize liver tissue size, maintenance and culture medium, scaffold gel, and viability assay. The needle method was found to be the easiest, most efficient, and cheap method for tissue processing as the equipment used was easily accessible and evaded enzymatic steps. Moreover, consistent samples that were all similar and in the desired size were easy to obtain. In addition to these, functionality and viability were analysed for 72 hours to assess the physiological state of the liver after tissue processing. Based on these findings a novel liver-on-a-chip system was successfully developed and as the next step, the invasion of the MDA-MB-231 breast cancer cell line towards the liver was investigated with and without the presence of C-X-C chemokine receptor type 4 (CXCR4) antagonists AMD3100 and AMD3465. In conclusion, this study demonstrated the development of a novel 3D model for the liver and provided a platform for studying breast cancer invasion with its potential implications for cancer therapy research. en_US
dc.description.abstract Karaciğer fizyolojisini yansıtan bir 3B hücre yüklü yonga-üzeri-karaciğer sistemlerinin geliştirilmesinde, uygun karaciğer hücre dışı matris (ECM) bileşenlerinin ve hücre tiplerinin belirlenmesi gibi zorluklarla karşılaşılmaktadır. Son yıllarda, bu soruna yönelik çözüm olarak doku dilimi tabanlı yöntemler kullanılmaktadır. Ancak bu yöntemler, kolayca erişilemeyen karmaşık ve ileri teknoloji cihazlar gerektirmektedir. Bu çalışma, basit ve uygun maliyetli yöntemler kullanarak 3B karaciğer modeli geliştirmesine odaklanmaktadır. Bunu başarmak için karaciğer dokusu boyutunun, bakım ve kültür ortamının, jel ortamının ve canlılık testinin optimize edilmesi amaçlanmıştır. Kullanılan ekipmanın kolay erişilebilir olması ve enzimatik basamaklara gerek kalmaması nedeniyle iğne yönteminin en kolay, verimli ve ucuz yöntem olduğu ortaya konmuştur. Ayrıca, bu yöntem ile hepsi birbirine benzeyen ve istenen boyutta tutarlı örnekler elde edilmesi mümkün olmuştur. Bunlara ek olarak, doku işleme adımlarından sonra karaciğerin fizyolojik durumunu değerlendirmek için 72 saat boyunca işlevsellik ve canlılık kontrol edilmiştir. Bu bulgulara dayanarak, yeni bir yonga-üzeri-karaciğer sistemi başarılı bir şekilde geliştirilmiştir. Ardından, geliştirilen sistem kullanılarak MDA-MB-231 meme kanseri hücre hattının karaciğere doğru invazyonu, C-X-C kemokin reseptörü tip 4 (CXCR4) antagonistleri AMD3100 ve AMD3465 varlığında ve yokluğunda analiz edilmiştir. Sonuç olarak, bu çalışma ile yeni bir 3B karaciğer modeli optimize edilerek kanser tedavisi araştırmalarında kullanılmak üzere meme kanseri invazyonunun incelenebileceği bir platform geliştirilmiştir. en_US
dc.format.extent x, 52 leaves
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/11147/13928
dc.language.iso en en_US
dc.publisher 01. Izmir Institute of Technology en_US
dc.rights info:eu-repo/semantics/embargoedAccess en_US
dc.subject Breast cancer cell en_US
dc.subject Chip systems en_US
dc.subject Liver-on-a-chip systems en_US
dc.title Optimization of a Liver Organ on Chip System for the Investigation of Breast Cancer Cell Invasion en_US
dc.title.alternative Meme kanseri hücrelerinin invazyon araştırmaları için bir karaciğer organ çipinin optimizasyonu en_US
dc.type Master Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
gdc.author.id 0000-0002-4775-1325
gdc.author.id 0000-0002-4775-1325 en_US
gdc.coar.access embargoed access
gdc.coar.type text::thesis::master thesis
gdc.description.department Thesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics en_US
gdc.description.publicationcategory Tez en_US
gdc.description.scopusquality N/A
gdc.description.wosquality N/A
gdc.identifier.yoktezid 823980 en_US
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery f009792b-87b4-4bc1-88fc-fb55aa7f481c
relation.isOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery 9af2b05f-28ac-4013-8abe-a4dfe192da5e

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Name:
10565963.pdf
Size:
2.1 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Master Thesis

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Name:
license.txt
Size:
3.2 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: