Kinetic and Structural Characterization of Interaction Between Trypsin and Equisetum Arvense Extract

dc.contributor.author Uslu, Mehmet Emin
dc.contributor.author Bayraktar, Oğuz
dc.contributor.author Ceylan, Çağatay
dc.coverage.doi 10.5505/tjb.2014.27870
dc.date.accessioned 2017-05-24T07:20:36Z
dc.date.available 2017-05-24T07:20:36Z
dc.date.issued 2014
dc.description.abstract Objective: In this study the inhibitory effect of E. arvense extract on trypsin activity and the effect of trypsin on E. arvense extract were studied. In addition the nature of the interaction between the extract and trypsin was investigated. Methods: The inhibitory effect ethanol extract of E. arvense on trypsin activity was determined using trypsin enzyme assay. The structural effects of the extract-trypsin interaction for the extract were analyzed by FTIR. Finally, the HPLC analyses were carried out to analyze the individual components of the extract and the supernatant and soluble precipitate phases. Results: E. arvense extract was found to decrease total percent activity of trypsin to 5% in 24 hour at 24 °C. FTIR analyses indicated that the interaction between trypsin and E. arvense extract caused changes in the structure and hydrogen bonding behavior and composition of the extract proteins. These interactions also caused the extract lipids to accumulate in the insoluble precipitate phase. Most of the phenolics remained in the supernatant phase enhancing the inactivation of trypsin. However, the precipitated compounds were shown to be of apolar in nature as shown in the HPLC chromatograms. Conclusion: The methods that were used showed that the high phenolic content of E. arvense was the main reason for the inhibition of trypsin enzyme activity by denaturing the enzyme. en_US
dc.description.abstract Amaç: E. arvense özütünün tripsin aktivitesi üzerinde ki engelleyici etkisinin ve de tripsinin özüt üzerinde ki etkisi bu çalışmada araştırılmıştır. Bunlara ek olarak ekstrakt ve tripsin arasında ki etkileşimin doğası araştırılmıştır. Metod: E. arvense bitkisinin etanol özütünün tripsin üzerinde ki engelleyici etkisi tripsin enzim analizi ile belirlenmiştir. Özüt tripsin etkileşiminin özüt üzerinde ki yapısal etkisi FTIR ile analizlenmiştir. Son olarak özütün, süpernetantın ve çözünebilir pelletin özgün bileşenlerin analizi ise HPLC ile belirlenmiştir. Bulgular: E. arvense özütünün total tripsin aktivitesini 24 °C sıcaklıkta ve 24 saat sonunda %5’e kadar düşürdüğü bulunmuştur. Yapılan FTIR analizleri ile tripsin ve E. arvense özütü arasındaki etkileşimin özüt proteinlerinin yapısında, kompozisyonunda ve hidrojen bağı yapma davranışında değişikliklere sebep olduğu anlaşılmıştır. Bu etkileşimler sebebiyle özütte bulunan lipidlerin çözünmez haldeki çökelti fazında toplandığı gözlemlenmiştir. Ayrıca fenolik bileşiklerin çoğunluğunun süpernetant fazında bulunması sebebiyle tripsin inaktivasyonunu arttırdığı anlaşılmıştır. Ancak çökeltide ki bileşiklerin apolar yapıda olduğu HPLC koromotogramları ile gösterilmiştir. en_US
dc.description.sponsorship İYTE Scientific Research Council (BAP) project numbers 2008İYTE22 en_US
dc.identifier.citation Uslu, M.E., Bayraktar, O., and Ceylan, Ç. (2014). Kinetic and structural characterization of interaction between trypsin and equisetum arvense extract. Turkish Journal of Biochemistry, 39(4), 463-471. doi:10.5505/tjb.2014.27870 en_US
dc.identifier.doi 10.5505/tjb.2014.27870
dc.identifier.doi 10.5505/tjb.2014.27870 en_US
dc.identifier.issn 0250-4685
dc.identifier.issn 1303-829X
dc.identifier.scopus 2-s2.0-84922476137
dc.identifier.uri https://doi.org/10.5505/tjb.2014.27870
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/11147/5592
dc.identifier.uri https://search.trdizin.gov.tr/yayin/detay/234237
dc.language.iso en en_US
dc.publisher Türk Biyokimya Derneği en_US
dc.relation.ispartof Turkish Journal of Biochemistry en_US
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess en_US
dc.subject Equisetum arvense en_US
dc.subject Fourier transform infrared spectroscopy en_US
dc.subject Phenolics en_US
dc.subject Trypsin en_US
dc.title Kinetic and Structural Characterization of Interaction Between Trypsin and Equisetum Arvense Extract en_US
dc.title.alternative Trypsin ve Equisetum Arvense Özütü Arasındaki Etkileşimin Kinetik ve Yapısal Karakterizasyonu en_US
dc.type Article en_US
dspace.entity.type Publication
gdc.author.institutional Uslu, Mehmet Emin
gdc.author.institutional Bayraktar, Oğuz
gdc.author.institutional Ceylan, Çağatay
gdc.bip.impulseclass C5
gdc.bip.influenceclass C5
gdc.bip.popularityclass C5
gdc.coar.access open access
gdc.coar.type text::journal::journal article
gdc.collaboration.industrial false
gdc.description.department İzmir Institute of Technology. Food Engineering en_US
gdc.description.endpage 471 en_US
gdc.description.issue 4 en_US
gdc.description.publicationcategory Makale - Ulusal Hakemli Dergi - Kurum Öğretim Elemanı en_US
gdc.description.scopusquality Q4
gdc.description.startpage 463 en_US
gdc.description.volume 39 en_US
gdc.description.wosquality Q4
gdc.identifier.openalex W2324528551
gdc.identifier.trdizinid 234237
gdc.index.type Scopus
gdc.index.type TR-Dizin
gdc.oaire.accesstype GOLD
gdc.oaire.diamondjournal false
gdc.oaire.impulse 0.0
gdc.oaire.influence 2.635068E-9
gdc.oaire.isgreen true
gdc.oaire.keywords Fourier transform infrared spectroscopy
gdc.oaire.keywords Trypsin
gdc.oaire.keywords Equisetum arvense
gdc.oaire.keywords Phenolics
gdc.oaire.popularity 7.742206E-10
gdc.oaire.publicfunded false
gdc.openalex.collaboration National
gdc.openalex.fwci 0.0
gdc.openalex.normalizedpercentile 0.15
gdc.opencitations.count 0
gdc.plumx.mendeley 3
gdc.plumx.scopuscites 0
gdc.scopus.citedcount 0
local.message.claim 2022-06-06T15:05:45.415+0300 *
local.message.claim |rp02965 *
local.message.claim |submit_approve *
local.message.claim |dc_contributor_author *
local.message.claim |None *
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery 8d2af00e-811a-4351-a3f3-a7f0b1847021
relation.isOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery 9af2b05f-28ac-4019-8abe-a4dfe192da5e

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Name:
5592.pdf
Size:
969.68 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Makale

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: