Synthesis and Characterization of Near-Infrared (nir) Emissive Conjugated Polymer Dots for Tumoroid Imaging

dc.contributor.advisor Yıldız, Ümit Hakan
dc.contributor.author Karabacak, Soner
dc.date.accessioned 2024-10-25T23:28:54Z
dc.date.available 2024-10-25T23:28:54Z
dc.date.issued 2024
dc.description Thesis (Doctoral)--İzmir Institute of Technology, Chemistry, Izmir, 2024 en_US
dc.description Includes bibliographical references (leaves. 111-124) en_US
dc.description Text in English; Abstract: Turkish and English en_US
dc.description.abstract This thesis describes the synthesis and characterization of near-infrared (NIR) emissive conjugated polymers and their polymer dots (Pdots). The Pdots were exploited to image the tumor cells and tumor spheroids. The penetration behavior of NIR emissive Pdots was characterized in five different tumor spheroid models. Three different polymerization techniques were tried to synthesize the NIR emissive polymers, namely oxidative, direct arylation, and Stille polymerization. The obtained NIR emissive polymers underwent structural and optical characterization. P1 was chosen as a model polymer to obtain Pdots from NIR emissive polymers for imaging tumoroids. Pdot preparation includes using ultrasonic emulsification to modify nonionic D-A-D type alkoxy thiophene-benzobisthiadiazole-based conjugated polymers (P1) with amphiphilic cetyltrimethylammonium bromide (CTAB). The technique yields Pdots with a significant positive surface charge of +56.5 mV ± 9.5 and an average hydrodynamic radius of 12 nm. Optical characterization reveals that these Pdots were found as emissive in the NIR region, with a maximum wavelength of 860 nm. These Pdots possess colloidal and optical properties that make them appropriate for use as fluorescence emissive probes in bioimaging applications. The advantageous use of positively charged Pdots has been proven in diffusion-limited settings such as tissues, specifically in certain tumor spheroid models produced from the tumoroid cell lines. After the fluorescence imaging analysis, the Pdots' emission intensity profile indicates that they have high penetration capability into the tumoroid models' center parts. The results show that Pdots with a single-chain donor-acceptor polymer structure that has been cationized with CTAB can penetrate through dense materials over about 1 μm. This provides valuable insights into the progression of targeted theranostic strategies in cancer therapy. en_US
dc.description.abstract Bu tez, yakın kızılötesi (NIR) ışıyan konjuge polimerlerin ve bunların polimer noktalarının (Pdot'lar) sentezini ve karakterizasyonunu açıklamaktadır. Pdot'lar, tümör hücrelerini ve tümör sferoidlerini görüntülemek için kullanıldı. NIR ışıyan Pdot'ların penetrasyon davranışı farklı tümör sferoid modellerinde karakterize edildi. NIR ışıyan polimerleri sentezlemek için oksidatif, direkt arilasyon ve Stille polimerizasyonu olmak üzere üç farklı polimerizasyon tekniği denendi. Elde edilen NIR ışıyan polimerlere yapısal ve optik karakterizasyon uygulandı. P1, tümörlerin görüntülenmesi için NIR ışıyan polimerlerden Pdot'lar elde etmek amacıyla model polimer olarak seçildi. Pdot hazırlığı, iyonik olmayan D-A-D tipi alkoksi tiyofen-benzobistiyadiazol bazlı konjuge polimerleri (P1) amfifilik setiltrimetilamonyum bromür (CTAB) ile modifiye etmek için ultrasonik emülsifikasyonun kullanılmasını içerir. Teknik, +56,5 mV ± 9,5 önemli pozitif yüzey yüküne ve 12 nm ortalama hidrodinamik yarıçapa sahip Pdot'lar sağlar. Optik karakterizasyon, bu Pdot'ların NIR bölgesinde maksimum dalga boyu 860 nm olan ışıyan olarak bulunduğunu ortaya koymaktadır. Bu Pdot'lar, onları biyogörüntüleme uygulamalarında floresans ışıyan problar olarak kullanıma uygun kılan kolloidal ve optik özelliklere sahiptir. Pozitif yüklü Pdot'ların avantajlı kullanımı, dokular gibi difüzyonun sınırlı olduğu ortamlarda, özellikle tümöroid hücre hatlarından üretilen belirli tümör sferoid modellerinde kanıtlanmıştır. Floresan görüntüleme analizinden sonra, Pdot'ların emisyon yoğunluğu profili, tümöroid modellerinin merkez kısımlarına yüksek nüfuz etme kapasitesine sahip olduklarını göstermektedir. Sonuçlar, CTAB ile katyonize edilmiş tek zincirli donör-alıcı polimer yapısına sahip Pdot'ların, yaklaşık 1 μm'nin üzerinde yoğun malzemelere nüfuz edebildiğini göstermektedir. Bu, kanser tedavisinde hedefe yönelik teranostik stratejilerin ilerlemesine ilişkin değerli bilgiler sağlar. en_US
dc.format.extent xv, 124 leaves
dc.identifier.uri https://tez.yok.gov.tr/UlusalTezMerkezi/TezGoster?key=UjlM15wKZGQW6TLC0pvCt7RZAwHncvjSxvIkYcY0PVun9lINZpUs8qpQHJhXyQTT
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/11147/14997
dc.language.iso en en_US
dc.publisher 01. Izmir Institute of Technology en_US
dc.subject Near infrared spectroscopy en_US
dc.subject Conjugated polymers en_US
dc.subject Biotechnology en_US
dc.subject Chemistry en_US
dc.subject Polymer Science and Technology en_US
dc.title Synthesis and Characterization of Near-Infrared (nir) Emissive Conjugated Polymer Dots for Tumoroid Imaging en_US
dc.title.alternative Tümöroid Görüntüleme için Yakin Kizilötesi (nır) İşiyan Konjuge Polimer Noktalarinin Sentezi ve Karakterizasyonu en_US
dc.type Doctoral Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
gdc.author.id 0000-0002-3147-8627
gdc.author.id 0000-0002-3147-8627 en_US
gdc.author.institutional Karabacak, Soner
gdc.coar.type text::thesis::doctoral thesis
gdc.description.department Thesis (Doctoral)--İzmir Institute of Technology, Chemistry en_US
gdc.description.publicationcategory Tez en_US
gdc.description.scopusquality N/A
gdc.description.wosquality N/A
gdc.identifier.yoktezid 890122 en_US
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery 7276df33-9019-4b6a-a416-391aee708196
relation.isOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery 9af2b05f-28ac-4011-8abe-a4dfe192da5e

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Name:
14997.pdf
Size:
8.02 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
Doctoral Thesis