Role of Sema6d in Proliferation, Epithelial-Mesenchymal Transition and Migration of Breast Cancer Cell Lines

dc.contributor.advisor Yalçın Özuysal, Özden
dc.contributor.author Şahi, Ece
dc.date.accessioned 2018-04-11T13:46:03Z
dc.date.available 2018-04-11T13:46:03Z
dc.date.issued 2017
dc.description Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics, Izmir, 2017 en_US
dc.description Full text release delayed at author's request until 2021.01.08 en_US
dc.description Includes bibliographical references (leaves: 33-36) en_US
dc.description Text in English; Abstract: Turkish and English en_US
dc.description.abstract Breast cancer is one of the most common cancer types around world and the second leading cause of cancer related deaths among women. Not the primary tumor but distant metastases are mainly the reason of deaths. For metastasis, the cells may go through epithelial-mesenchymal transition (EMT), and acquire migration and invasion abilities. SEMA6D is a transmembrane protein that belongs to a large semaphorin family. SEMA6D is involved in the migration of embryonic cardiac cells. Recently it was validated as an oncogene in osteosarcoma. Also, its oncogenic roles were investigated in gastric cancer and mesothelioma. According to in silico analysis of the Cancer Genome Atlas (TCGA), high SEMA6D expression level is associated with better survival of triple negative breast cancer patients. However, there is not any published study which investigates roles of SEMA6D in breast cancer yet, other than bioinformatic analysis. Therefore, we aimed to understand role of SEMA6D in proliferation, EMT and migration of breast cancer cells. We observed that overexpression of SEMA6D reduces proliferation but enhances migration in non-invasive breast cancer cell line MCF7. Thereby, SEMA6D may increase metastatic ability of MCF7 cells. Its metastatic ability was also supported by changes in EMT markers. On the other hand, proliferation of metastatic breast cancer cell line MDAMB231 was not significantly changed by overexpression of SEMA6D and migration ability was slightly reduced but mesenchymal markers tended to increase in SEMA6D overexpressing MDAMB231 cells. As a conclusion, SEMA6D tends to enhance proliferation, migration through EMT in MCF7 cell line whereas overexpression of SEMA6D did not demonstrate significant effect on metastatic MDA-MB-231 cell line. Therefore, we should separately evaluate role of SEMA6D in different breast cancer cell lines and further studies are required to understand role of SEMA6D in breast cancer. en_US
dc.description.abstract Meme kanseri dünyada yaygın görülen bir kanser çeşidi olmakla birlikte meme kanseriyle alakalı ölümler metastazdan kaynaklanmaktadır. Metastaz yapabilmek için kanser hücreleri göç etme ve invazyon özellikleri kazanırlar ve hücreler bu süreçte epitelmezenkimal geçiş gösterebilir. SEMA6D, semaforin ailesine bağlı transmembran bir proteindir. SEMA6D embriyonik kıkırdak hücrelerinin göç etmesinde görev alır. Son zamanlarda osteosarkoma’da onkogen olarak değerlendirilmektedir. Ayrıca onkogen fonksiyonları, mide kanseri ve mezotelyoma’da da keşfedilmiştir. Biyoinformatik analize göre, SEMA6D’nin gen ifadesi üçlü negatif meme kanseri olan hastaların yaşamlarıyla ilişkilendirilmiştir fakat SEMA6D’nin meme kanseri üzerindeki görevleri ve fonksiyonları ile ilgili yayınlanmış bir çalışma bulunmamaktadır. Bu sebeple, bu tez çalışmasında SEMA6D’nin meme kanseri hücrelerinde çoğalma, epitel-mezenkimal geçiş ve göç etme özelliklerini anlamak amaç edinilmiştir. Bu çalışmada, SEMA6D’nin aşırı ekspresyonu, invazyon yeteneği olmayan meme kanseri hücre hattı MCF7’da çoğalmayı azaltmış fakat göç etmeyi arttırmıştır. SEMA6D’nin metastatik özelliği ayrıca epitel-mezenkimal geçiş ile de desteklenmiştir. Diğer yandan, SEMA6D’nin aşırı ekspresyonu metastatik ve agresif olan MDA-MB-231 hücre hattında çoğalmayı etkilememiş fakat göç etme yeteneğini azalttığı gözlemlenmiştir. Sonuç olarak, SEMA6D, MCF7 hücre hattında çoğalmayı, epitel-mezenkimal geçiş aracılığıyla göç etme yeteneğini arttırırken, metastatik olan MDA-MB-231 hücre hattında önemli bir değişiklik yapmamıştır. Bu yüzden, SEMA6D’nin görevlerini değerlendirirken farklı hücre hatlarında farklı etkilere yol açabileceğini göz önünde bulundurmak ve görevlerini daha detaylı anlamak için daha fazla çalışma yapmak gerekmektedir. en_US
dc.format.extent ix, 36 leaves
dc.identifier.citation Şahi, E. (2017). Role of SEMA6D in proliferation, epithelial-mesenchymal transition and migration of breast cancer cell lines. Unpublished master's thesis, İzmir Institute of Technology, İzmir, Turkey en_US
dc.identifier.uri https://hdl.handle.net/11147/6876
dc.language.iso en en_US
dc.publisher Izmir Institute of Technology en_US
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess en_US
dc.subject Breast cancer en_US
dc.subject SEMA6D en_US
dc.subject Epithelial-mesenchymal transition en_US
dc.subject Proteins en_US
dc.subject MCF7 cells en_US
dc.title Role of Sema6d in Proliferation, Epithelial-Mesenchymal Transition and Migration of Breast Cancer Cell Lines en_US
dc.title.alternative Sema6d'nin Meme Kanseri Hücre Hatlarının Çoğalma, Epitel-mezenkimal Geçiş ve Göç Etmesindeki Rolü en_US
dc.type Master Thesis en_US
dspace.entity.type Publication
gdc.author.institutional Şahi, Ece
gdc.coar.access open access
gdc.coar.type text::thesis::master thesis
gdc.description.department Thesis (Master)--İzmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics en_US
gdc.description.publicationcategory Tez en_US
gdc.description.scopusquality N/A
gdc.description.wosquality N/A
relation.isAuthorOfPublication.latestForDiscovery f009792b-87b4-4bc1-88fc-fb55aa7f481c
relation.isOrgUnitOfPublication.latestForDiscovery 9af2b05f-28ac-4013-8abe-a4dfe192da5e

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Name:
T001714.pdf
Size:
5.14 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Description:
MasterThesis

License bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Name:
license.txt
Size:
1.71 KB
Format:
Item-specific license agreed upon to submission
Description: