OpenAIRE Collection / OpenAIRE Koleksiyonu
Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/17
Browse
2 results
Search Results
Article Silika Yüzeylerin Islanma Hareketlerinin Moleküler Dinamik ile Modellenmesi(Gazi Üniversitesi, 2018) Barışık, MuratYeni üretim tekniklerine paralel olarak nano-boyutlu teknolojiler çok geniş bir uygulama alanında kullanılmaya başlanmakta ve yeni uygulamalar geliştirmek için keşfedilmesi ve anlaşılması gereken konular süratle artmaktadır. Bu doğrultuda, yeni uygulamalarda sıkça yer bulan silikon ve silikon-dioksitin mikro/nano boyutlardaki malzeme özelliklerinin anlaşılmasına büyük ihtiyaç oluşmaktadır. Özellikle bu yüzeylerin ıslanma hareketlerinin anlaşılabilmesi ve hatta kullanılacak uygulamaya göre ayarlanabilmesi sayısız uygulama için önem arz etmektedir. Bu nedenlerle, nano-teknolojide sıkça kullanılan silikon-dioksit malzemesinin ve su moleküllerinin nano-ölçeklerde moleküler olarak modellenmesi bu çalışmada gerçekleştirildi. Modelleme molekuler dinamik hesaplamaları ile yapıldı. Silikon-dioksit yüzey üzerinde nano su damlacıkları oluşturup, denge halinde oluşan ıslatma açısı ölçümleri yapıldı. Literatürde işlem yükünü azaltmak için sıklıkla uygulanan, katı yüzey termal titreşimlerinin ıslatmaya olan etkisinin ihmal edilmesi ve modellenmemesinin ıslatma açısına olan etkisi incelendi. Katı moleküllerin termal titreşimlerinin ıslatma modellenen ıslatma fiziğine baskın bir etkisi olduğu görüldü. Geçtiğimiz yıllarda doğa taklidi olarak bilinen çalışma çevreleri tarafından hayata geçirilmeye çalışılan Lotus yaprağı etkisi temelli yüzey ıslatma kontrolu moleküler seviyede uygulandı. Yüzey üzerinde oluşturulan nano boyutlardaki yüzey yapılarının ıslanma açısını değiştirebildiği gösterildi. Temiz (0 0 1) silika yüzeyinde nano ölçek çizgi gerilimi etkisi altında ölçülen ıslanma açısının deneysel silika ıslanma açısı aralığında olduğu bulundu.Article Alteration of Protein Localization and Intracellular Calcium Content Due To Connexin26 D50a and A88v Mutations(Türk Biyokimya Derneği, 2017) Aypek, Hande; Meşe, GülistanIntroduction: Connexins (Cx) play essential roles in cellular homeostasis by forming gap junctions and non-junctional hemichannels. In vitro characterization of Cx26 mutations causing keratitis-ichthyosis-deafness (KID) syndrome, were shown to form leaky hemichannels. The molecular/ cellular mechanisms affected by aberrant hemichannels have recently been elucidated. Here, we further wanted to characterize Cx26 KID syndrome mutations, D50A and A88V, which were shown to form aberrant hemichannels and remained unaddressed in the literature. Methods: Neurobiotin uptake assay in HeLa and N2A cells transfected with Cx26-WT, D50A or A88V verified the presence of aberrant hemichannels and immunofluorescent staining with fluorescent microscopy determined cellular localization of Cx26. Finally, intracellular calcium content was examined by using calcium indicator, Fluo-3AM, and flow cytometer. Results: Cx26-D50A and A88V mutations prevented the formation of gap junction plaques at cell-cell appositions and mutant proteins were observed to localize to the Golgi apparatus. Further, comparison of intracellular calcium content showed an increase in calcium amount in cells containing Cx26-D50A and A88V relative to Cx26-WT. Conclusion: Retention of Cx26 in the Golgi apparatus and alteration in the intracellular calcium content due to KID syndrome mutations may influence various cellular processes that might contribute to development of epidermal phenotypes.