Chemistry / Kimya

Permanent URI for this collectionhttps://hdl.handle.net/11147/4072

Browse

Filters

2017 - 201962020 - 20242

Settings

Author: search.filters.author.Yıldız, Ümit HakanWoS Q: search.filters.wosQuartile.N/A

Search Results

Now showing 1 - 8 of 8
  • Article
    Citation - Scopus: 3
    Development of Chrono-Spectral Gold Nanoparticle Growth Based Plasmonic Biosensor Platform
    (Elsevier, 2024) Sözmen, Alper Baran; Elveren, Beste; Erdoğan, Duygu; Mezgil, Bahadır; Baştanlar, Yalın; Yıldız, Ümit Hakan; Arslan Yıldız, Ahu
    Plasmonic sensor platforms are designed for rapid, label-free, and real-time detection and they excel as the next generation biosensors. However, current methods such as Surface Plasmon Resonance require expertise and well-equipped laboratory facilities. Simpler methods such as Localized Surface Plasmon Resonance (LSPR) overcome those limitations, though they lack sensitivity. Hence, sensitivity enhancement plays a crucial role in the future of plasmonic sensor platforms. Herein, a refractive index (RI) sensitivity enhancement methodology is reported utilizing growth of gold nanoparticles (GNPs) on solid support and it is backed up with artificial neural network (ANN) analysis. Sensor platform fabrication was initiated with GNP immobilization onto solid support; immobilized GNPs were then used as seeds for chrono-spectral growth, which was carried out using NH2OH at varied incubation times. The response to RI change of the platform was investigated with varied concentrations of sucrose and ethanol. The detection of bacteria E.coli BL21 was carried out for validation as a model microorganism and results showed that detection was possible at 102 CFU/ml. The data acquired by spectrophotometric measurements were analyzed by ANN and bacteria classification with percentage error rates near 0% was achieved. The proposed LSPR-based, label-free sensor application proved that the developed methodology promises utile sensitivity enhancement potential for similar sensor platforms. © 2024 The Author(s)
  • Research Project
    Çeşitli ilaç etken maddelerinin kapiler elektrokromatografi ile tayini için yeni kapiler kolonlar geliştirilmesi
    (2018) Eroğlu, Ahmet Emin; Çağır, Ali; Karabudak, Engin; Yıldız, Ümit Hakan
    Projenin amacı, üç farklı ilaç etken madde grubundan beta-blokerler (metoprolol ve atenolol), anti-kanser ilaçları (5-florourasil ve azasitidin) ve diüretik ilaçların (bendroflumetiazid, klorotiazid ve hidroklorotiazid), kapiler elektroforez ve kapiler elektrokromatografi ile tayini için yeni metotlar gelistirilmesidir. Ilk çalısmada, anti kanser ilaçların etken maddesi olan 5- florourasil ve 5-azasitidin için farklı formülasyonlara (farklı fonksiyonel monomerler, porojenler ve monomer:çapraz baglayıcı oranları) sahip moleküler baskılanmıs polimerler (MIP) sentezlendi. Çözelti pH?sı, çalkalama süresi, sorbent miktarı gibi parametreler optimize edildi ve bu kosullarda 5-FU ve 5AC için dedeksiyon limit (LOD) degerleri sırasıyla 0.40 mg/L ve 0.28 mg/L ve tayin limit (LOQ) degerleri 1.33 mg/L ve 0.92 mg/L olarak hesaplandı. Ikinci çalısmada, analit grubu olarak seçilen tiazidlerin belirlenmesinde kullanılacak kapiler elektrokromatografi kolonu hazırlanması için sol-jel kimyası ve moleküler baskılama teknigi kullanıldı. Modifiye silika sol-jeller (amin- ve fenil-modifiye) ve farklı MIP materyalleri (inorganik- ve organik-bazlı) duragan faz kaplama malzemesi olarak kullanılmak için sentezlendi. Kolon içine yüklenecek maddenin seçimi için kapiler elektroforez (CE) öncesinde sorpsiyon çalısması yapıldı. Kritik deneysel parametreler optimize edildi; elektrolit çözeltisi olarak pH?sı 9.4?e ayarlanmıs 10.0 mM borat seçildi. Çalısma voltajı 25 kV, kaset sıcaklıgı 30.0 °C?ye sabitlendi. LOD degerleri 0.20 mg/L ile 0.30 mg/L, LOQ degerleri 0.44 mg/L ile 0.99 mg/L arasında bulundu. Çalısmanın üçüncü kısmında, ß-blokerlerin tayini için moleküler baskılanmıs organik-inorganik polimerler ve sol-jel metoduyla silikat nanopartikülleri sentezlendi ve kapiler elektrokromatografi kolonunda kaplama/dolgu malzemesi olarak kullanıldı. Sentezlenen üç farklı sorbentin sorpsiyon performansı kıyaslandı. Moleküler baskılanmıs organik polimerlerin metoprolole yüksek sorpsiyon kapasitesi ve seçicilik gösterdigi belirlendi. Duragan faz optimizasyon çalısmalarından sonra CEC kolonu gelistirildi ve analitik performansı incelendi. Söz konusu kolonla yapılan çalısmalarda metoprolol için LOD ve LOQ degerleri sırasıyla 10.0 mg/L ve 32.0 mg/L olarak hesaplandı.
  • Conference Object
    Citation - WoS: 1
    Citation - Scopus: 1
    Biomimetic Peptide-Conjugated Membranes for Developing an Artificial Cornea
    (IEEE, 2022) Sunal, Gülşah; Pulat, Günnur; Akgün, İsmail Hakkı; Güven, Sinan; Yıldız, Ümit Hakan; Karaman, Ozan; Horzum, Nesrin
    The corneal endothelium is composed of a single layer of specialized endothelial cells, protecting, and nourishing the inner surface of the cornea. Corneal endothelial cells do not proliferate after birth and their number decrease with age. Trauma, inflammation, or surgical intervention can cause cell loss. When damage is extensive and the density of corneal endothelial cells decreases to a critical level, it results in corneal edema and vision loss. Besides them, when corneal endothelium has irreversible damage, the only treatment way is corneal transplantation. But there are some drawbacks such as finding donors, immune reactions, and the number of patients waiting on the transplantation lists for years. Tissue engineering approaches can provide promising alternatives for the regeneration of corneal endothelium tissue. Peptides can be used to modify and functionalize the scaffolds, allowing for the production of bioactive and biomimetic surfaces. Peptide-modified scaffold surfaces might direct and enhance the behaviors of cells. In this study, the aim was to functionalize the polycaprolactone (PCL) membranes with tissue-specific peptides and to characterize the peptide-conjugated membranes by Fourier-Transform Infrared Spectroscopy (FTIR), Scanning Electron Microscopy (SEM), and X-ray Photoelectron Spectroscopy (XPS) analysis. The synthesized peptides were successfully conjugated on the PCL biomembranes.
  • Conference Object
    Citation - Scopus: 2
    Utilization of Near Ir Absorbing Gold Nanocolloids by Green Synthesis
    (Trans Tech Publications, 2018) Elveren, Beste; Yıldız, Ümit Hakan; Arslan Yıldız, Ahu
    The rapid developments in nanoscience, and its applications on biomedical areas have a large impact on drug delivery, tissue engineering, sensing, and diagnosis. Gold is widely investigated nanomaterial for the last couple of decades, since it has unique surface properties and very low toxicity to biological environment. In this work, we present a novel synthesis of gold nanoparticles (GNPs) exhibiting both visible and near-IR absorbance without agglomeration. The surface of GNPs were analyzed by routine methods and the binding kinetics were investigated by Surface Plasmon Resonance (SPR) Spectroscopy. The unique optical properties of near-IR asorbing GNP colloids hold promise for biological applications.
  • Conference Object
    Citation - WoS: 1
    Citation - Scopus: 4
    Polymer Nanofiber-Carbon Nanotube Network Generating Circuits
    (SPIE, 2018) Mutlu, Mustafa Umut; Akın, Osman; Yıldız, Ümit Hakan
    The polymer nanofiber carbon nanotube (CNT) based devices attracts attention since they promise high performance for next generation devices such as wearable electronics, ultra-light weighted appliances and foldable devices. This abstract describes the utilization of polymer nanofibers and CNT as major component of low cost foldable photo-resistor. We use polymer nanofiber as template guiding CNTs to generate nanocircuits and conductive sensing network. The controlled combination of CNTs and polymer nanofibers provide opportunities for device miniaturization without loss of performance. The nanofiber-CNT network based photo-resistor exhibits broad band response 400 to 1600 nm that holding promises for ultra-thin devices and new sensing platforms.
  • Conference Object
    Citation - Scopus: 2
    Fabrication of Polymer Nanofiber-Conducting Polymer Fabric and Noncontact Motion Sensing Platform
    (Trans Tech Publications, 2018) Mutlu, Mustafa Umut; Akın, Osman; Demir, Mustafa Muammer; Yıldız, Ümit Hakan
    Conductive polymer-electrospun polymer nanofiber network was combined to host iron oxide nanoparticles providing micrometer thick sensing interface. The sensor has fabricated as freestanding fabric exhibiting 10 to 100 KOhm base resistivity upon bias applied. The moving object has been sensed through the electrostatic interactions between fibers and object. The sensing range has been found to be 1-5 cm above the surface of fabric. By the controlled combination of conductive polymers electrospun polymer nanofibers effective device miniaturization has been provided without loss of performance. The noncontact motion sensor platform has unique flexibility and light weight holding a potential for wearable sensor technology.
  • Conference Object
    Kanser Öntanısı için Hücredışı Veziküller Kullanılarak Plazmonik Temelli Metodoloji Geliştirme
    (Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., 2017) Erdoğan, Duygu; Alduran, Yeşim; Yıldız, Ümit Hakan; Arslan Yıldız, Ahu
    Son yıllarda, vücut sıvılarında bulunan hücredışı veziküller kanserde tanı biyobelirteci olarak kullanılmaktadır. Veziküllerin içeriği kanserin türünü ve seviyesini belirlemede rol oynayabilmektedir. Bu vezikülleri yakalama işleminde, genel olarak, Akış Sitometrisi (Flow cytometry), Western Blot, Enzime-bağlı İmmunosorbent Deneyi (ELISA) ve Yüzey Plazmon Rezonansı (SPR) metodolojileri kullanılmaktadır. Bu çalışmada vezikülleri yakalamaya yönelik plazmon temelli bir deney platformu üretilmesi önerilmiştir. Bu plazmonik platform, yüzeyde yapılacak modifikasyonlarla, yüksek hassasiyet oluşturabileceğimiz Lokalize Yüzey Plazmon Resonansı temellidir.
  • Conference Object
    Üç Boyutlu Hücre Kültürü için Polimer Esaslı Ekstrasellüler Matriks Mimetiği
    (Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., 2017) Türker, Esra; Yıldız, Ümit Hakan; Arslan Yıldız, Ahu
    Elektro-eğirme metodu gelişmiş üretim teknolojilerindendir ve biyomedikal uygulamalarında yaygın olarak kullanılmaktadır. Özellikle doku mühendisliğinde amaç, çalışılacak doku üzerine doğal veya sentetik destek materyali (iskele) üreterek hücrenin uyum sağlayabileceği bir ortam oluşturmaktır. Bu projenin amacı üç boyutlu (3D) hücre kültürü çalışmaları için elektro-eğirme-metodu ile poli(L-laktik-co-epsilon-kaprolakton) (PLLCL) kullanılarak iskele üretilmesidir. Homojen lifler ve uygun gözenek boyutu elde etmek amacıyla optimizasyon çalışmaları yapılmıştır. Elde edilen liflerin çapı, akış hızı ve voltajın artmasıyla azalmaktadır. Taramalı uç elektron mikroskop incelemeleri (SEM) lif morfolojik yapılarının doku iskelesi fabrikasyonu için ideale yakın olduğunu ortaya çıkarmıştır.